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帕金森病家系GDNF基因启动子测序和其CpG岛甲基化分析
徐州医学院硕士学位论丈
缩略词表
Abbreviation
缩略词 英文全称 中文全称
COBRACombinedwith restrictive结合亚硫酸盐限制性分析
sulphite
analysis
5’to 磷酸胞苷酰
CpG Cytosinespositionedguaosines
DA Dopamine 多巴胺
cell
GDNF The line-derived
glial neurotrophic胶质细胞源性神经营养因
factor 子
MSP PCR 甲基化特异性PCR
Methylationspecific
MS.SNuPE sensitive 甲基化敏感的单核苷酸引
Methylationsingle—nucleotide
extensionmethod 物延伸法
primer
NTFs factors 。神经营养因子
Neurotrophic
PCR chainreaction 聚合酶链反应
Polymerase
PD Parkinson’Sdisease 帕金森病
RLGS Restrictivemarker scan 限制性标记基因组手1描
genome-wide
SNPs nucleotide 单核苷酸多态性
Single polymorphisms
徐州医学院硕士学位论丈
帕金森病家系GDNF基因启动子测序及其
CpG岛甲基化分析
中文摘要
目的探讨GDNF基因启动子的变异或其CpG岛的异常甲基化与PD家系中
PD发病的关系。
方法从PD家系成员的外周血中提取全血DNA,应用引物设计软件针对第
一启动子设计2对引物和3组甲基化和非甲基化引物,第二启动子区及第二外显
子区设计l对引物和4组甲基化和非甲基化引物:应用聚合酶链反应(PCR)进行
GDNF基因2个启动子扩增,并用基因测序技术进行测序,然后应用DNAstar软
件进行序列变异分析。采用甲基化特异性PCR(MSP)技术扩增2个启动子区及
第二外显子区的甲基化和非甲基化产物,并用琼脂糖凝胶电泳观察GDNF基因2
个启动子区及第二外裎子区CpG岛的甲基化情况。
结果GDNF基因第一个启动子区发现了2个变异位点,是目前已知的多态
位于转录结合区;而第二个启动子区未发现变异。GDNF基因2个启动子区及第
二外显子区的CpG岛上无异常甲基化。
结论 1.PD家系中PD的发病町能与GDNF基因第一启动子区的2个多态
位点有关。2.PD家系中PD的发病与GDNF基因启动子突变无关。3.PD家系
中PD的发病与GDNF基因CpG岛的异常甲基化无关。
关键词 帕金森病;胶质细胞源性神经营养因子;DNA甲基化;甲基化特异性
PCR
2
徐州医学院硕士学位
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