焦磷酸深度测序检测HIV-1劣势耐药株方法的建立和初步应用.pdfVIP

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2017-09-06 发布于贵州
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焦磷酸深度测序检测HIV-1劣势耐药株方法的建立和初步应用.pdf

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焦磷酸深度测序检测HIV-1劣势耐药株方法的建立和初步应用

目录舅邺一 3．焦磷酸深度测序结果的解读……………………………………………………………．42 参考文献…………………………………………………………………………………………43 附录我国“十一五”HIV／AIDS抗病毒治疗队列一说明…………………………………47 致谢……………………………………………………………………………………………………………………………．．49 2 缩略词表缩略词英文全称中文全称加S Immune Syndrome获得性免疫缺陷综合症 AcquiredDeficiency ADR Resistance 获得性耐药 AcquiredDrug AS-PCR ChainReaction位点特异性聚合酶链式反应 Polymerase Allele—Specific bp basepair 碱基对 cARTCombinedAntiretroviral 联合抗反转录病毒疗法 Therapy DNA Acid 脱氧核糖核酸 Deoxyribonucleic DPS DeepPyrosequencing 焦磷酸深度测序 HⅣ Human Virus 人类免疫缺陷病毒 Immunodeficiency NNRHsNon．Nucleoside inhibitors非核苷类逆转录酶抑制剂 reverse-transcriptase NRTIsNucleoside inhibitors核苷类逆转录酶抑制剂 reverse-transcriptase RNAribonucleicacid ．核糖核酸 RT reverse 逆转录酶 tmnscdptase RT-pCRreverse chainreaction逆转录聚合酶链反应 transcriptionpolymerase SGS Genome 单基因组测序 Single Sequence 勰 resistance 传播耐药性 transmitt甜drug In叮AIDSUnitedNations onHIV／AIDS联合国艾滋病规划署 Pr0蹦衄e UDPSultra-deeppyrosequencing 焦磷酸超深度测序眨 viralIDad 病毒载量中文摘要【目的】：建立焦磷酸测序检测HlV-1耐药劣势株平台，利用该方法探究HIV耐药劣势株在中国HIV／AIDS初治且疗效不佳患者中的流行数据及所起到的作用。防．法l：通过寡核苷酸标准品及人工合成序列对焦磷酸定量测序的线性、敏感性突变位点设计包括PCR及焦磷酸测序引物，测序碱基分配顺序等测序方案。研究对象以我国“十一五”HⅣ-／A]DS抗病毒治疗队列一(即初治患者)为基础，选取其中病毒学治疗失败患者，取起始治疗前血浆及部分病毒