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第7章 真核基因表达的调控-中
第七章 真核基因表达调控;第七章 真核基因表达调控;真核生物RNA聚合酶Ⅱ的启动子结构;第三节 真核基因的转录
2.转录模板:一个转录单元,包括转录起始位点到终止处的全部DNA序列。
3.RNA聚合酶II:多个亚基组成。
4.转录所需的蛋白因子:参与转录的起始、延伸和终止。 ;第三节 真核基因的转录
5.增强子
增强子是指能使它连锁的基因转录频率明显增强的DNA序列。 ;;第三节 真核基因的转录
5.增强子
5.1特性
增强效应十分明显
增强效应与其位置和取向无关
大多为重复序列
其增强效应有严密的组织和细胞特异性
没有基因专一性,可以在不同的基因组合上表现增强效应
许多增强子还受外部信号的调控;第三节 真核基因的转录
5.增强子
增强子的功能是可以累加的。SV40增强子序列可以被分为两半,每一半序列本身作为增强子功能很弱,但合在一起,即使其中间插入一些别的序列,仍然是一个有效的增强子。因此,要使一个增强子失活必须在多个位点上造成突变。对SV40增强子而言,没有任何单个的突变可以使其活力降低10倍。 ;第三节 真核基因的转录
5.增强子
5.2增强子的作用原理
影响模板附近DNA 的双螺旋结构,以蛋白质之间的相互作用为媒介形成增强子与启动子之间“成环”连接,活化基因转录;
将模板固定在细胞核内特定位置,促进RNA聚合酶II在DNA链上的结合和滑动;
增强子区可以作为反式作用因子或RNA聚合酶II进入染色体结构的“入口”。;增强子作用机理 ; 一个增强子可通过将蛋白质带到启动子附近行使其功能。增强子在长线形DNA的相反末端不起作用,但当DNA在蛋白质桥作用下连接成环状时,却能有效地发挥作用。增强子和启动子在两个分开的DNA环上时不起作用,但两环连接时却发生作用。;第四节 反式作用因子对转录的影响;真核生物中转录因子活性调节的主要方式;真核生物中转录因子活性调节的主要方式;真核生物中转录因子活性调节的主要方式;1.DNA结合结构域基序
a.螺旋-转角-螺旋结构(Helix-turn-helix)
是最早发现于原核生物中的一个关键因子,该结构域长约20个aa,主要是两个α-螺旋区和将其隔开的β转角。其中的一个被称为识别螺旋区,因为它常常带有数个直接与DNA序列相识别的氨基酸。 ;螺旋-转角-螺旋结构;螺旋-转角-螺旋(helixturnhelix,HTH)基序 ;b.锌指结构(Zinc finger)
长约30个aa,其中4个氨基酸(2个Cys(半胱氨酸),2个His(组氨酸))与一个Zinc原子相结合。与Zinc结合后锌指结构较稳定,有Zinc参与时才具有转录调控活性 。;锌指结构;锌指(zinc finger) ;c.同源域蛋白(Homeodomain)
最早来自控制躯体发育的基因,长约60个氨基酸,其中的DNA结合区与 helix-turn-helix motif相似,人们把该DNA序列称为homeobox。主要与DNA大沟相结合。 ;d.亮氨酸拉链(Leucine zippers) 是亲脂性(amphipathic)的α螺旋,包含有许多集中在螺旋一边的疏水氨基酸,两条多肽链以此形成二聚体。每隔6个残基出现一个亮氨酸。由赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)组成DNA结合区。 ;碱性-亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP) ;第四节 反式作用因子对转录的影响;e. 碱性螺旋--环--螺旋
(basic helix-loop-helix) 该调控区长约50个aa残基,同时具有与DNA结合和形成蛋白质二聚体的功能,其主要特点是可形成两个亲脂性α-螺旋,两个螺旋之间由环状结构相连,其DNA结合功能是由一个较短的富碱性氨基酸区所决定的。 ;第四节 反式作用因子对转录的影响;2. DNA结合蛋白主要转录激活结构域
b. 谷氨酰胺丰富区(glutamine-rich domain) SP1是启动子GC盒的结合蛋白,其N末端含有2个主要的转录激活区,氨基酸组成中有25%的谷氨酰胺,很少有带电荷的氨基酸残基。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳动物的OCT-1、OCT-2、Jun、AP2和SRF也含有这种结构域。 ;2. DNA结合蛋白主要转录激活结构域
C.脯氨酸丰富区(proline-rich domain) CTF家族(包括CTF-1、CTF-2、CTF-3)的C末端与其转录激活功能有关,含有20%-30%的脯氨酸残基,很难形成α-螺旋。
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