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DNAPKcs短发夹RNA载体构建及其表达
DNAPKcs短发夹RNA载体构建及其表达
作者:田晓予,邢辉,翁丹慧,陈刚,卢云萍,马丁
【摘要】 目的 构建DNAPKcsshRNA表达载体,观察该基因的抑制对A2780细胞增殖活性的 影响 。 方法 将针对人DNAPKcs基因的不同部位设计的shRNA插入到真核表达质粒并转染人卵巢A2780细胞,RTPCR和WesterBlot检测其对该基因mRNA和蛋白水平的抑制效率,MTT法测定DNAPKcs基因的抑制对肿瘤细胞增殖活性的影响。结果 DNA 测序 分析 证实DNA-PKcs shRNA表达载体pSIRENDNAPKcs shRNA构建成功并在细胞中表达,转染重组载体的A2780细胞DNA-PKcs的表达在mRNA和蛋白水平均明显下降;重组载体转染细胞增殖活性明显降低。 结论 成功构建DNA-PKcs shRNA表达载体为进一步 研究 DNA损伤修复基因DNA-PKcs奠定了基础;DNA-PKcs表达的抑制可能会导致肿瘤细胞增殖活性降低。
【关键词】 DNAPKcs基因;短发夹RNA;真核表达载体;细胞增殖活性
The Construction of DNAPkcs Shorthairpin siRNA Recombinant Vector and Its Expression in Vitro 毕业论文
Key words:DNAPKcs; shRNA; Eukaryotic expression vector; Proliferation activity
DNAPKcs蛋白是DNA蛋白依赖激酶(DNAdependent ProtEin Kinase,DNAPK)的催化亚基,在人类的DNA双链断裂(DSBs)的主要修复途径NEHJ(nonhomologous endjoining)中发挥重要作用。本课题选择DNAPKcs编码区基因序列,与真核表达载体pSIREN构建DNAPKcs的短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA),在细胞内发挥RNA干扰作用,在转录后水平特异性封闭DNAPKcs基因的表达,观察该基因的抑制对卵巢癌A2780细胞增殖的影响,并为进一步研究该基因生物作用奠定实验室基础。 毕业论文
1 材料与方法 论文代写
1.1 材料
1.1.1 细胞及主要试剂 毕业论文
卵巢癌A2780细胞株(武汉大学医学保障中心), 胎牛血清(杭州四季青公司),1640培养液(Gibco BRL公司),质粒 pSIRENDNRDsRedExpress(BD Clontech公司), DH5α(清华天为 时代 ),质粒小提试剂盒(北京博达泰克公司),凝胶回收试剂盒和质粒大提试剂盒(Qiagen公司), Lipfectinamine2000脂质体转染试剂盒(Invitrogen公司), PCR反应试剂盒(Fermentas公司),Trizol试剂(Invirtogen公司),各种工具酶(Takara公司),DNAPKcs单克隆抗体(Neomarker公司),碱性磷酸酶抗鼠IgG(晶美公司),BCIP/NBT显色试剂盒(武汉凌飞 科技 有限公司),MTT(Sigma公司), PCR引物及shRNA表达载体插入片段的寡核苷酸链由北京奥科生物公司合成,DNAPKcs shRNA表达载体的测序由大连亚法生物技术公司完成。 论文代写
1.1.2 主要仪器
CO2培养箱(Hereaus公司), PCR仪和蛋白垂直电泳系统(美国BioRad公司),酶标仪(美国Biotek公司产)。
1.2 方法
1.2.1 DNAPKcs 特异性shRNA转绿模板设计
选择人类DNAPKcs(Genebank U47077 )cDNA两个部位作为目标序列,根据 目前 通用的siRNA设计原则, 应用 hppt:// 提供的“siRNA target finder and design tool” 设计DNAPKcs 特异的19mt寡核苷酸序列加入9bp的loop环结构、U6启动子终止序列及两端的BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位点,全长67bp ,以形成发卡状siRNA(shRNA)转录模板,正义链1:5GATCCCATGGCAGGAGAGAATCAGTTCAAGAGACTGATTCTCTCCTGCCATGTTTTTTGGAAG3’反义链1:5AATTCTTCCAAAAAACATGGCAGGAGAGAATCAGTCTCTTGAACTGATTCTCTCCTCCATGG3’正义链2: 5GATCCCTTTATGGTGGCCATGGAGCAAGAGACTCCATGG
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