林木基因组学研究进展.pdfVIP

植物生理与分子生物学学报, Journal of Plant Physiology and Molecular Biology 2006, 32 (2): 133-142 133 综　述Review 林木基因组学研究进展 1* 2 甘四明 ，苏晓华 1 2 ( 中国林业科学研究院热带林业研究所，广州510520 ； 中国林业科学研究院林业研究所，北京 100091) 摘要：林木基因组学研究进展迅速。结构基因组学方面， 1　林木结构基因组学 已构建了近40 个主要造林树种的遗传连锁图谱，在不同 树种中定位了30 余个重要的数量性状位点，在部分树种 结构基因组学指基因组作图和测序以及对已测 中开展了基因组比较和综合图谱构建研究，杨树的全基 序基因组上基因序列结构的研究(Chawla 2002) 。林 因组测序已经完成，桉树的全基因组测序正在进行。功能 木结构基因组学在遗传图谱构建、数量性状位点 基因组学方面，已分析了主要造林树种多种组织的转录 (quantitative trait locus, QTL)定位、比较基因组作图 组EST 序列，对林木次生生长与木材形成、开花和抗寒 性的形成等过程开展了功能基因组学研究。另外，探讨了 和基因组测序等方面都取得了巨大进展。 林木基因组学研究的发展趋势，以期为我国林木基因组 1.1　林木遗传图谱构建 学研究提供有益的参考。 到目前为止，已构建了近40 种重要造林树种的 遗传图谱。早期构建的林木遗传图谱的密度不高， 关键词：林木；结构基因组学；功能基因组学 标记类型不多，主要是操作上较简便的 R A P D 中图分类号：Q7 4 (random amplified polymorphic DNA)标记和/ 或早期 常用的RFLP(restrictive fragment length polymorphism) 基因组(genome)是一个物种单倍体细胞内所有 标记。近年来，随着林木 SSR(simple sequence repeats, 基因和基因之间序列的总称。基因组学(genomics)是 也称微卫星)标记的开发、EST(expressed sequence 对基因和遗传信息在基因组上如何组织以及如何决定 tag) 数据的快速积累和一些功能基因的克隆，SSR 、 基因功能的研究，可分为结构基因组学(structural EST 和候选基因(candidate gene, CG)越来越多地作为 genomics) 和功能基因组学(functional genomics) 分子标记用于林木遗传图谱的构建。表 1 列出了 (Chawla 2002) 。上世纪80 年代末、90 年代初，世 2000 年以来发表的主要林木遗传连锁图谱。 界范围内启动了人类基因组计划，其后微生物、动 林木遗传图谱构建中有几个问题值得注意：一 物和植物的基因组学研究蓬勃兴起。 是标记的偏分离(distortion