霍乱弧菌新类型溶源性噬菌体基因组结构探究.docVIP

霍乱弧菌新类型溶源性噬菌体基因组结构探究 　 作者：芮勇宇，阚飙，高守一，刘延清，祁国明 【关键词】 霍乱弧菌；噬菌体；序列分析, 　　摘要：目的 研究霍乱弧菌埃尔托型（EVC）新类型溶源性噬菌体（CTXφ）和核心区不含ctxAB基因的溶源性噬菌体（nct-CTXφ）基因组的结构。方法 采用基因扩增、测序及序列生物信息学等方法进行观察与分析。结果 在我国EVC中，存在仅携带古典型（class）nct-CTXφ、CTXφ或埃尔托型（ET）CTXφ基因组类型，并发现nct-CTXclassφ和CTXETφ共存、nct-CTXnewETφ和CTXclassφ共存的新类型。CTXφ和nct-CTXφ基因组zot基因3′末端，60bp序列中40%位点不同，推测的氨基酸序列中60%位点不同。class、ET和newET类型ig1、rstR和ig2基因序列同源性分别为770%～974%，104%～179%，96%～648%，RstR同源性92%～241%。CTXφ基因组均位于染色体TLC基因簇附近。上述不同类型EVC的tcpA、TcpA、ctxA、ctxB、CtxA和CtxB与GenBank中EVC和O139群产毒株的同源性分别gt;99%，99%，99%，98%，98%和96%。结论 首次在EVC中发现nct-CTXclassφ和CTXETφ、nct-CTXnewETφ和CTXclassφ共存