生物多样性资讯学及台湾与全球资讯之整合.PDFVIP

生物多樣性資訊學及臺灣與全球資訊之整合 生物多樣性資訊學及臺灣與全球資訊之整合 生物多樣性資訊學及臺灣與全球資訊之整合生物多樣性資訊學及臺灣與全球資訊之整合 邵廣昭 中央研究院生物多樣性研究中心 一、一 、生物多樣性資訊學之由來生物多樣性資訊學之由來 一一 、、生物多樣性資訊學之由來生物多樣性資訊學之由來 「生物多樣性」及「永續發展」是第一次地球高峰會中所通過的《21 世紀 議程》（agenda 21）中最重要的兩個主軸議題。《生物多樣性公約》。迄今簽署之 國家已逾 190 國，臺灣因非聯合國之會員國，故無緣簽署此一全球最大之國際組 織，但每年定期召開之締約國大會，我政府均爭取以觀察員之身份與會，一方面 是避免臺灣遭受國際孤立而影響我在政治、經濟、社會、科教及民生等各方面之 權益；二來也是要為臺灣的永續發展、生物多樣性與環境之保護而採取積極有效 的作為。因此與生物多樣性有關之任何資訊之取得，或與國際間資訊之合作與交 流也都是我們應該要努力推動的工作。 「生物多樣性公約」中第十七條即為資訊交流，公約要求各國應採取共同行 動，建立及維持國家的、地區的和全球的資訊交換機制（clearing house mechanisms, CHM），並與其他各國分享。此資訊交流包括生物多樣性相關之技 術、科學和社經之研究成果，及培訓和調查計劃之資訊、專門知識，當地和傳統 知識等等。又由於傳統分類學遭到輕忽，分類學人才快速流失，勢將導致許多生 物多樣性保育、教育及研究工作無法順利地推展。因此振興分類學研究之能力建 設（capacity building）也成為公約中最基礎且十分重要的跨議題 （cross-cutting issue）之一。生物多樣性之危機不僅僅是地球上的物種消失 而已，也包括了科學家尤其是分類學家過去研究所辛苦累積的寶貴經驗與知識之 快速流失。如何才能將這些知識予以保存及利用，似乎得靠數位化及建置資料庫 才能達成。其實早在 1980 年代由系統分類學家所發起之《2000 年系統學議程》 （Systematic Agenda 2000）即已闡明了分類學家應致力於三大任務：（一）發 現生物多樣性，（二）了解生物多樣性及，（三）納入資訊管理系統 （圖 1）。 但當時並無人真正重視生物多樣性資訊之重要，直到生物多樣性公約開始推動， 資訊科技在近廿年來之飛躍進展，才使生物多樣性的科學家們開始體認到「「生物生物 「「生物生物 多樣性資訊學」（多樣性資訊學」（biodiversity informaticsbiodiversity informatics））之重要。他們也發現其實分類學 多樣性資訊學多樣性資訊學」（」（biodiversity informaticsbiodiversity informatics）） 是可以藉著數位典藏及資訊之傳播而獲得振興及快速發展，也有希望在數十年內 完成全球物種的編目，這向過去認為是不可能的任務。也因此在近幾年來的 Nature 及 Science 期刊上已有多篇文章報導分類學的新世紀或生物多樣性資訊 之興起及其未來展望的文章，特別是未來可望在網路上取得所有生物分類和鑑定 等相關研究工作所需的各類資訊，包括未來可上網發表新種或論文等等。 圖 1 系統學議程（Systematic Agenda 2000）之倡議目的在振興分類學之研究， 資料庫之建置與整合系分類學家三大任務之一 「生物資訊學」（bioinformatics），這個時下最熱門的領域，原本包括了 基因、物種和生態系三個不同層次的所有生物多樣性之資料，但因分子生物或基 因（DNA）之資料在過去廿年來的飛躍進展，以及人類和若干物種之基因庫被完 全解碼後，其龐大之資訊量幾乎已佔據了所有生命資訊之全部。也因此「生物資 訊學」已成為研究基因資料庫之代名詞，被 DNA 序列之資訊先行佔用 （preoccupied），故所有物種及生態系層次之資料乃被迫歸併到另一名詞「生 物多樣性資訊學」中。直到最近「生物學的資訊學」才被再細分為：（一）遺傳 及分子層次之「生物資訊學」，如 GenBank, SwissProt.等商用資料庫；（二） 個體（