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2、蛋白质序列数据库 由瑞士Swiss Institute of Bioinformatics 和 European Bioinformatics Institute合建 / 蛋白质数据库 3、蛋白质结构数据库(PDB) 由美国Brookhaven National Laboratory开发 4、蛋白质二级结构数据库(DSSP) Wolfgang Kabsch and Chirs Sander设计 http://www.sander.ebi.ac.uk/dssp ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/dssp 蛋白质数据库 绪论 A 蛋白质化学 B 蛋白质工程概念 C 蛋白质工程操作流程 D 蛋白质工程研究方向 E 蛋白质数据库 F 蛋白质工程研究成果及存在问题 G 基因工程概念 H 蛋白质工程与基因工程的联系与区别 蛋白质工程的成果 1、基础研究方面: 酪氨酰tRNA合成酶是应用蛋白质工程技术 研究得比较深入的酶之一。该酶在ATP 存在的 条件下可催化酪氨酸活化──酪氨酸转移到tRNA 的3末端形成酪氨酰tRNA 2、实际应用方面: 到目前为止尽管人类已经发现了数千 种酶,但是真正具有商业价值即每年销售 额可超过1000万美元的酶不过数十种。 蛋白质工程的成果 诱变蛋白质 氨基酸突变 原定目标 结果 T4溶菌酶 Ilu→Cys 构建二硫键 成功 增加热稳定性 枯草杆菌 Gly→Lys 拓宽酶作用的 成功 蛋白酶 底物范围 Ala→Leu 提高抗氧化性能 α-抗凝酶 Met→Val 提高抗氧化性能 成功 胰蛋白酶 Gly→Ala 提高酶水解专一性 成功 β-内酰胺酶 Ser→Cys 验证Ser对该酶 成功 的重要性 β-干扰素 Cys→Ser 提高稳定性 成功 白细胞介素-2 Cys→Ser 提高产物活性 不成功 二氢叶酸 Asp→Asn 验证酶的活性 成功 中心还原酶 蛋白质工程在医学上的应用 1)提高蛋白质的稳定性 如葡萄糖异构酶 (GI)突变型GI比野生型的 热半衰期长一倍;最适反应温度提高10-12℃; 2)融合蛋白质 化学合成的脑啡肽 EnkN端5肽编码区,通过一 连接3肽编码区与人α1型干扰素 IFN基因连接, 在大肠杆菌中表达这一融合蛋白 ,融合蛋白抑制 肿瘤细胞生长的活性显著高于单纯的IFN 3) 机械功能(Mechanical functions) 4) 运动功能(Movement) striated skeletal muscle cell 5).信息传递功能(Information processing) Simple Anatomy of the Retina ★ 蛋白质的生物学意义 蛋白质是一切生物细胞和组织的主要组成部分,是生命活动所依据的物质基础 2.生物的各种生物功能也都靠蛋白质体现。如细胞结构、生物催化、物质传输、运动、防御、调控以及记忆、识别等方面 1)发现了数千种不同功能和来源的蛋白质 2)其中上千种蛋白质的氨基酸排列顺序已被测定出来 3)上百种已获得高分辨的分子结构解析图 这些成就,特别是蛋白质结构与功能的特殊联系方 面的成就, 为改造蛋白质奠定了关键的基础 蛋白质化学的研究成果 绪论 A 蛋白质化学 B 蛋白质工程概念 C 蛋白质工程操作流程 D 蛋白质工程研究方向 E 蛋白质数据库 F 蛋白质工程研究成果及存在问题 G 基因工程概念 H 蛋白质工程与基因工程的联系与区别 诞生: 一张蓝图 上世纪70年代,结构生物学揭示了大量蛋白质分子的精确立体结构及其与复杂生物学功能的关系,为设计改造天然蛋白质提供了蓝图。 一项工具 分子遗传学发展了以定点诱变为中心的基因操作技术,为通过基因修饰改造蛋白质提供了工具。 蛋白质工程 蛋白质工程 诞生的标志: 1982年,Winter通过基因定位右边得到了改性的酪氨酸tRNA合成酶。 1983年,Ulmer在“Science”上发表以“Protein Engineering” (蛋白质工程)为题的专论,一般将此视为蛋白质工程
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