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分子动力学模拟的原理简介 授课人：杨俊升 博士 内 容 1 分子模拟的应用 2 分子动力学计算的原理 3 体系模型构建 4 分子动力学模拟实例 一、分子模拟的应用 1.分子模拟概述 定义： 计算机辅助试验技术，以原子水平的分子模型来 模拟分子的结构与行为、体系的各种物理化学性质。 2.分子模拟的作用 模拟材料的结构 计算材料的性质 预测材料的行为 验证试验结果 重现试验过程 从微观角度认识材料 总之，是为了更深层次理解结构，认识各种行为。 介观动力学 分子力学、动力学 量子力学 密度泛函理论 E [(r ,...r )] E [n(r)] Hohenberg-Kohn 1 N theorem E  T  U  E      o xc Walter Kohn Kohn-Sham  2   veff [n(r)] (r)   (r) equations i ,k i ,k i ,k 荣获1998年的诺贝尔化学奖    * n(r ) f (r )  (r ) •Exact only for ground state  ii i i  3 •Needs approximation to Exc N n(r )d r  这三位科学家结合经典和量子物理学，设计出多尺度复杂化学系统 模型，将传统的化学实验搬到了网络世界。 第一原理研究领域包括： 晶体材料结构优化及性质研究（半导体、陶瓷、金属、分子筛等） 表面和表面重构的性质、表面化学 电子结构（能带、态密度