十微生物的分类和鉴定.ppt

第十一章 微生物的分类和鉴定 Classification and identification 概 论 地球上到底有多少物种至今仍无准确答案，估计有分类记录的各类物种大约有150万，其中微生物超过10万。微生物学工作者要认识、研究和利用微生物或控制有害微生物，必须对它们进行分类（classification）。 微生物分类学（microbial taxonomy）是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon）的科学。它的具体任务有：分类、鉴定（identification）和命名（nomenclature）。 第一节 通用分类单元 一、 分类单元及其等级 分类单元（taxon）是指具体的分类群，如原核生物界（Procaryotae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）、枯草芽胞杆菌（Bacillus subtilis）等都分别代表一个分类单元。微生物的分类单元一般也分为七个基本的分类等级（rank或category）或分类阶元。由上而下依次是：界、门、纲、目、科、属、种。分类单元的等级（阶元）只是分类单元水平的概括，它并不代表具体的分类单元。 种以上的分类单元 Domain（域） Kingdom（界） Phylum（门） Class（纲） Order（目） Family（科） Genus（属） Species（种） 二、 种的概念 种（species）是生物分类中基本的分类单元和分类等级，指一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（type strain）来作具体标本，故这一典型菌株就是该种的模式种（type species）。 新种：是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。 三、 学名 学名是指一个菌种的科学名称，它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。一个种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组组成。 （一）双名法 学名=属名（斜体）+种的加词（斜体） +（首次定名人）+现名定名人+定名年份 例：大肠埃希氏菌（大肠杆菌） Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 四、 亚种以下的分类单元 亚种以下的分类单元（infrasubspecific taxa）很多，其提出和使用均不受细菌命名法规的限制。 1.亚种（subspecies,subsp.,ssp.） 2.变种（variety,var.） 3.型（form） 4.类群（group） 5.菌株（strain） 6.小种（race） 7.相（phase） 8.态（state） 第二节 微生物在生物界的地位 (1) 两界系统：1753年，瑞典博物学家林奈，在其名著《植物种志》中，第一次科学地提出动物界（ Animalia）、植物界（Plantae）两界系统。 （2）三界系统：1866年，德国动物学家E.H.Haeckel 建议在动物界和植物界之外，应加上一个由低等生物组成的第三界：原生生物界，它主要由一些单细胞生物和无核类生物组成。 （3）四界系统：1956年，Copeland提出了生物可分为四界的学说，即：动物界、植物界、原始生物界（原生动物、真菌、部分藻类）和菌界（细菌和蓝细菌）。 第三节 各大类微生物的分类系统 分类学的最终目标是要建立起一套比较接近生物系统发育规律的自然分类系统。 （1）简介 《伯杰氏手册》最早成书于1923年，第一版名为《伯杰氏鉴定细菌学手册》，主要编者为美国学者D. Bergey等人。此后，由其他学者不断修订，已先后出版了11个版本。从1980年起，该手册组织了国际上20多个国家的300多位专家，合作编写了4卷本的新手册，书名改为《伯杰氏系统细菌学手册》，并于1984年至1989年间分4卷陆续发行。此书是目前国际上最为流行的实用版本。《伯杰氏系统细菌学手册》的第二版从2000年起分成5卷陆续发行。 第四节 微生物的鉴定 菌