全新药物设计方法与常用软件及其在抗癌药物设计中的应用.pdfVIP

药学实践杂志2014年1月25日第32卷第1期 of JournalPharmaceutical 9 Practice，V01．32，No．1，January25，2014 ·综述· 全新药物设计方法与常用软件及其在抗癌药物设计中的应用 殷 丽，陈临溪(南华大学药物药理研究所，湖南衡阳421001) [摘要]计算机辅助药物设计已普遍应用于药物研发过程，大大加快了药物开发的速度。特别是全新药物设计方法可 等，常用方法有片段连接、片段生长、侧链替换和骨架跃迁等。全新药物设计方法在一些抗癌化合物，如纺锤体驱动蛋白抑制 剂、血管内皮生长因子抑制剂、亲环蛋白A抑制剂和BRAF抑制剂等的发现方面，已经发挥了重要作用。综述全薪药物设计 方法与常用软件，并举例讨论其在新型抗癌药物领域中的应用。 [关键词]全新药物设计；抗癌药；LUDI；LigBuilder；LeapFrog [中图分类号] R914．2 [文献标志码]A [文章编号]1006一叭11(2014)ol一0009—08 [DoI]10．3969／j．issn．1006—0111．2014．01．003 ofthecommonsoftwareandmethodsofde inthe novo Applications drugdesign antitumor drugdesign YIN of and ofSouth Li，CHENLinxi(Institute China，Hunan421001，China) PharmacyPharmacology，University Hengyang aided hadbecomeofthe the of de· [Abstract]Computerdrugdesign part drugdiscoveryprocess，greatlyimprovedspeeddrug withtraditional methods．In denovo methodcouldbeusedto velopmentcompared drugfinding particular，thedrugdesign identifylig· for andswithnovelstructurea couldfindnewideasabouthowto a specialtarget．Throughcomputersimulation，researchers change to the orhowtoassemblesome to candidateswhichbe compoundimprovedrugproperties fragmentsgenerate accessibleand fora commonsoftwareofdenovo included highaffinitytarget．The design and methodswere linkand chain moleculee— SIS，BREED，LeapFrogRACHEL，etc．The fragments grow，sidereplacement，parent