蛋白质网络中复合体和功能模块预测算法研究.pdfVIP

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2017-10-12 发布于福建
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蛋白质网络中复合体和功能模块预测算法研究.pdf

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第卷第期计算机学报３４７　　　　　　　　　Ｖｏｌ．３４Ｎｏ．７年月２０１１７Ｊｕｌ２０１１ＣＨＩＮＥＳＥＪＯＵＲＮＡＬＯＦＣＯＭＰＵＴＥＲＳｙ　蛋白质网络中复合体和功能模块预测算法研究鱼亮高琳孙鹏岗　　　　（西安电子科技大学计算机学院西安）７１００７１　　摘要预测蛋白质相互作用网络中的复合体和功能模块对于理解生物系统的组织和功能具有重要的意义到目．　　前为止，已经出现了大量的蛋白质复合体和功能模块预测算法及相关的软件，这些算法各具特色，但同时也具有一定的局限文中对典型的聚类预测算法进行了研究，依据算法特性对它们进行了分类，并从算法思想、关键技术以．及算法性能等方面进行了分析和比较进一步介绍了基于网络比对策略检测保守模块的算法最后，结合蛋白质网．．，络数据集对典型的聚类算法从运行效率和预测结果的匹配率等方面进行了比较与分析为生物网络模块的挖掘和分析提供了有益的参考．关键词蛋白质相互作用网络复合体功能模块聚类算法；；；；　中图法分类号号：／ＴＰ３０１犇犗犐１０．３７２４ＳＰ．Ｊ．１０１６．２０１１．０１２３９　　　犚犲狊犲犪狉犮犺狅狀犃犾狅狉犻狋犺犿狊犳狅狉犆狅犿犾犲狓犲狊犪狀犱犉狌狀犮狋犻狅狀犪犾犕狅犱狌犾犲狊犘狉犲犱犻犮狋犻狅狀犻狀犵狆犘狉狅狋犲犻狀犘狉狅狋犲犻狀犐狀狋犲狉犪犮狋犻狅狀犖犲狋狑狅狉犽狊ＹＵＬｉａｎＧＡＯＬｉｎＳＵＮＰｅｎＧａｎ　　ｇｇｇ（，，）犛犮犺狅狅犾狅犆狅犿狌狋犲狉犛犮犻犲狀犮犲犪狀犱犜犲犮犺狀狅犾狅犡犻犱犻犪狀犝狀犻狏犲狉狊犻狋犡犻′犪狀７１００７１犳狆犵狔狔　犃犫狊狋狉犪犮狋Ｐｒｅｄｉｃｔｉｎｒｏｔｅｉｎｃｏｍｌｅｘｅｓａｎｄｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｍｏｄｕｌｅｓｉｎｒｏｔｅｉｎｒｏｔｅｉｎｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ　ｇｐｐｐｐ（）ＰＰＩｎｅｔｗｏｒｋｓｉｓｖｅｒｉｍｏｒｔａｎｔｔｏｕｎｄｅｒｓｔａ