第三章生物信息的传递(上)——从dna到rna.pptVIP

* 第二节 启动子与转录起始 1.启动子的基本结构 （1）启动子：是一段位于结构基因5 ′端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确的相结合并具有转录起始的特异性。 （2）转录单元：是一段从启动子开始至终止子结束的DNA序列。 (3)转录起点：是指与新生RNA链地一个核苷酸相对应DNA链上的碱基。 （4）绝大部分启动子都存在-10区和-35区 -10区：在-6~-13bp之间，共同序列为TATAAT，又称pribnow框，酶在此处与DNA结合成稳定的复合物，在转录方向上解开双链形成开放型起始结构。 -35区：共同序列为TTGACA，是RNA聚合酶起始识别区，这一识别过程与?因子有关。 2.启动子的识别 RNA聚合酶并不与直接识别碱基对本身，而是通过氢键互补的方式加以识别。 3. 酶与启动子区的结合 RNA聚合酶首先与启动子区闭合双链DNA相结合，形成二元闭合复合物，然后经过解链得到二元开放复合物。 4. -10区和-35区的距离 -10区和-35区相距约20bp，大致是双螺旋绕两周的长度，两个结合区在分子的同一侧面。 5. 增强子及其功能 （1）增强子：使与它连锁的基因转录频率明显增强的DNA序列，是基因表达的重要调节元件。 （2）作用机制：通过改变模板DNA的整体结构（影响DNA-Pro复合物的结构或改变DNA超螺旋密度） （3）特点： A. 增强效应明显（10 – 200倍）； B. 增强效应与其位置和取向无关； C. 大多为重复序列，一般约为50bp； D. 增强效应有严密的组织和细胞特异性，只有特定的蛋白质（转录因子）参与才能发挥其功能； E. 没有基因专一性。 6. 真核生物启动子对转录的影响 （1.）原核和真核基因转录起始点上游区的结构差异 A. 原核基因启动区范围较小，TATAAT的中心位于-7~-10，上游-30~-70为正调控因子结合序列，+1~-20为负调控因子结合序列；真核基因的调控较大， TATAAT的位于-20~-30，-40~-110区为上游激活区。 B. 原核基因启动子上游只有TTGACA作为RNA聚合酶的主要结合位点，参与转录调控；真核基因除了CAAT外，大多数还有GC区和增强子区。 （2）启动子区对转录的影响 A. TATA区主要是使转录精确的起始。 B. CAAT区和GC区主要控制转录起始的频率，基本不参与起始位点的确定。 C. CAAT区对转录起始频率的影响最大，该区任一碱基的改变都将极大地影响基因的靶转录强度。 D. 在CAAT区和相邻的两个UPE区之间插入核苷酸也会使转录减弱。 第三节 原核生物和真核生物mRNA的特征比较 原核生物mRNA的特征 1. 原核生物mRNA的半衰期短。 2. 许多原核生物mRNA以多顺反子的形式存在 （1）单顺反子：只编码一个蛋白质的mRNA。 （2）多顺反子：编码多个蛋白质的mRNA。是一组相邻或相互重叠基因的转录产物。 （3） 所有mRNA都包括：编码区、位于AUG之前的5 ′端上游非编码区、位于终止密码子后不翻译的3 ′端下游非编码区 （ 4. ）在多顺反子中，后面几个顺反子翻译的起始受其上游顺反子的调控。 3. 原核生物mRNA的5 ′端无帽子结构， 3 ′端没有或只有较短的poly（A） 二. 真核生物mRNA的特征 真核生物mRNA的5 ′端存在帽子结构 （1） mRNA5 ′端加“G”的反应是由腺苷酸转移酶完成的。 （2） mRNA的帽子结构常常被甲基化。 （3）帽子结构可能使mRNA免遭核酸酶的破坏。 （4）5 ′端帽子结构的功能 保护mRNA免受5’-核酸外切酶降解； 使mRNA进入细胞质； 对翻译起识别作用（ m7G5’ppp5’Np 优先与 核糖体结合）。 2. 绝大多数真核生物mRNA具有poly（A）尾巴 （1）真核生物mRNA的加尾反应. （2） poly（A）尾巴的功能 第四节 终止和抗终止 1.不需要ρ 因子的转录终止——强终止子 特点：DNA序列有双重对称，形成末端发夹结构，模板DNA上有一串A， RNA3’端有UUUU，使新合成的 RNA脱落。 2. 需要ρ 因子的转录终止 终止子后无连续的A， 在ρ 因子作用下，ATP酶水解，释放能量，使新生RNA与模板脱落。 3. 抗终止 方式： （1）破坏终止位点RNA的茎-环