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第二章细胞内生物分子相互作用概述

阻遏蛋白Cro对λ噬菌体DNA的结合: Cro蛋白是大肠杆菌噬菌体产生的阻遏蛋白,它可以识别并结合DNA上一段专一序列,是一个重要的调节蛋白,并且二者的结合是由于它们的结构特征,同时Cro蛋白的结合保护了其他蛋白质与DNA作用的特定位点。 Cro蛋白以二聚体形式与DNA螺旋结合 ε.coli的CAP蛋白与ε.coliDNA的某一调控位点相结合: 大部分被特异性蛋白识别结合的序列都具有一定的对称性,而且许多顺序特异性的DNA结合蛋白是多亚基蛋白,它们形成对称性的排列,这种排列有助于识别对称序列;另外蛋白质的α螺旋通常位于DNA螺旋的大沟中,是DNA-蛋白质相互作用的一个普遍特征。 蛋白质与蛋白质的相互作用—多亚基形式的组合 多亚基体系具有的特点: 可减少蛋白质合成过程中随机错误对蛋白质活性的影响 对DNA的利用来说,多亚基较为经济 多亚基蛋白质的活性能够很有效和很迅速的被开启和关闭—酶的活性调节 糖与蛋白质的相互作用 糖蛋白:是蛋白质与寡糖链通过糖苷键连接成的产物,寡糖链由多种单糖构成,每一个单糖具有半缩醛羟基和一个以上的醇羟基,单糖间可通过不同苷键连接。 糖蛋白中的糖肽连接类型: 在糖蛋白中仅有一种糖残基与天冬酰胺相连,即N-乙酰-?-D-葡糖胺,生成的键是4-N-(2-乙酰氨基-2-脱氧-?-D-吡喃葡糖基)-L-天冬酰胺,这种连接方式有时称为N(或Asn)连接型糖链或N-聚糖。 糖基或糖链的还原端与蛋白质肽链中的Ser、Thr或羟赖氨酸羟基中的氧原子相连称为O-连接糖链。 蛋白聚糖:主要存在于人或者动物的皮肤、软骨、角膜等部位的结缔组织中。 软骨蛋白聚糖是由硫酸角质素和硫酸软骨素与核心蛋白共价结合在一起形成蛋白聚糖单体,由蛋白聚糖单体、连接蛋白和透明质酸形成蛋白聚糖聚集体。 脂与蛋白质的相互作用 脂蛋白是由脂质和蛋白质相互作用的复合物,脂与蛋白质的结合可以通过蛋白质Ser、Thr上的羟基与脂质上羧基形成酯键,或蛋白质上的-SH与脂质上的羧基形成硫酯键。 血浆酯蛋白结构 研究生物大分子的方法 离心技术分离生物大分子: 密度梯度离心 等密度离心 差速离心 凝胶电泳技术(DNA分离及大小测定) 蛋白质分子质量测定: SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 本章习题 简述生物分子自我组装的定义和种类,并举例说明生物分子的自我组装过程? 简述生物分子间的相互作用? 第四条 在漫长的生物进化过程中,优胜劣汰导致存活的生物体能够适应外界变化的环境条件,表现适应性,可能在某个基因上发生突变,也就是有利突变 * 如血红蛋白是由两个α球蛋白链和两个β球蛋白链构成的α2β2四聚体。 * 多糖功能:提供能量 脂类:组成膜,保护性外鞘及其他细胞结构的重要组分 * 水是一个高度缔合的化合物就是因为水存在着氢键,具有强内聚力、高汽化热,从而为细胞提供一个稳定的内环境 疏水相互作用:两个难溶于水的分子或者分子的某些基因之间的相互作用。例不溶于水的分子因为水的氢键而使水分子在其周围形成了一个“壳”,两个不溶于水的分子就形成了两个这样的“壳”,由于几何学的原因两个分子就会互相接触。水分子数目少于分离的水分子数目,因此微溶于水的分子就有成簇的趋势,这种趋势就是疏水相互作用 离子键:正负电荷的引力 二硫键:肽键适当位置的两个半胱氨酸之间可通过氧化脱氢而形成的二硫键,维持肽链高级结构 配位键:一些金属离子能与含氮、氧的集团间形成一种特殊的共价结合,形成的化合物为络合物 * * Cro蛋白石大厂杆菌噬菌体产生的阻遏蛋白,主要作用于当细菌进入裂解阶段时关闭溶原阶段早期基因的表达。作用方式是识别并结合细菌DNA上一段专一序列。 * 如果一个蛋白质含有多个亚基,某一个亚基出现了差错,但是以多亚基形式组成的蛋白质可以维持其正常的功能,因为这个缺陷的亚基将完全渗入到多亚基蛋白质中,通常形成一个正常的蛋白质。 * * 第二章 细胞内生物分子 相互作用概述 蛋白质——氨基酸 核酸——核苷酸 多糖——单糖 脂类——单脂 无论是原核生物还是真核生物,对一个生命个体来讲,均由蛋白质、核酸、糖类、脂类等生物大分子和一些小分子化合物及无机盐等这些化学成分共同组成。 生物大分子 生物大分子的功能: 生物体是由生物大分子等有机物构成的; 生物体能与环境不断地交换物质与能量; 所有生物大分子共同存在于细胞环境中; 生物体能进行自我更新。 细胞 细胞器官(真核细胞) 超大分子组装体 生物大分子 构件分子 代谢物 前体 元素 C H O N P S H2O CO2 NH3 丙酮酸 柠檬酸 苹果酸

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