(生物信息学课件)第1讲简介.ppt

王元茂 安徽中医药大学 生物信息学 第一讲 简介 生物信息学（Bioinformatics）是20世纪80年代末随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新型交叉学科，它体现了生物学、计算机科学、数学、物理学等学科间的渗透与融合。 生物信息学通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，达到揭示数据所蕴含的生物学意义从而解读生命活动规律的目的。 生物信息学不仅是一门学科，更是一种重要的研究开发平台与工具，是今后进行几乎所有生命科学研究的推手。 潜伏在你身边的生物技术 生物技术与生物信息学的区别及联系 生物信息学的发展历史 人类基因组计划（HGP） 生物信息学的研究领域 生物信息学的主要应用 生物信息学数据库 数据库建设 数据库整合和数据挖掘 序列分析 序列对比 基因序列注释 蛋白质结构分析 系统生物学 分子进化与系统发育 生物信息学面临的挑战 分子生物学是多种学科交叉而成的新学科，现有的形势仍表现为各种学科之间的简单堆砌，然而相互之间的联系并不是特别的紧密。 人类的DNA序列是人类的真谛，这个世界上发生的一切事情，都与这一序列息息相关。然而，要完全破译这一序列以及相关的内容，我们还有很长的路要走。 “一场与工业革命和以计算机为基础的革命有相同影响力的变化正在开始。下一个伟大的时代将是基因组革命时代，它现在处于初期阶段” -- 《第三次技术革命》 Tankertanker Design 生物技术 生物信息学 英文名称 Biotechnology Bioinformatics 最终目的 产品 研究 方法 利用生物的特性和功能，设计构建具有预期功能的新物质或品系 对生物信息进行采集、处理、存储、分析和解释 涉及学科 基因工程、分子生物学、生物化学、遗传学、细胞生物学、胚胎学、免疫学等 生物学、计算机科学、数学、物理学等 发展历程 可追溯到 2000 B.C. 数十年 人类基因组计划由美国科学家于1985年提出，1990年启动。根据该计划，在2015年要把人体约4万个基因的密码全部揭开，同时绘制出人类基因的谱图，也就是说，要揭开组成人体4万个基因的30亿个碱基对的秘密。HGP与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划，被誉为生命科学的登月计划。(百度百科) 随着基因组计划的不断发展，海量的生物学数据必须通过生物信息学的手段进行收集、分析和整理后，才能成为有用的信息和知识。换句话说，人类基因组计划为生物信息学提供了兴盛的契机。上文所说的基因、碱基对、遗传密码子等术语都是生物信息学需要着重研究的地方。 分子生物学与细胞学 分子和生态进化 生物物理学 农林牧渔学 脑和神经科学 医药学 + GenBank Blast XML SQLServer MySQL Intergration Data Mining ? MDR Clustal X 多重序列对比结果 基因组测序只能测出整个DNA的碱基对排列顺序，不能直接测出DNA上的基因及其功能，必须通过生物信息学方法，结合蛋白组学、转录组学，对测出来的序列进行分析，将基因及其功能加以挖掘、注释，这称作基因注释。因为基因本质上就是一种信息，没有什么生物功能（生物功能是蛋白质来体现的） Tankertanker Design