民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索.pdfVIP

21 每地震业学撮 2013，22(10)：15 Ac￡n Bore口Zi—occide行￡nZisSi扎icn Agric“f￡“r口P 6 网络出版时间：2013—10一1 民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索 杨月莹1’2…，刘 娣4 (1．黑龙江省农业科学院博士后科研工作站，哈尔滨150086；2．东北林业大学博士后科研流动站，哈尔滨150040 150086) 3．东北农业大学理学院，哈尔滨 150030；4．黑龙江省农业科学院，哈尔滨 摘要 面对小样本海量特征的基因芯片数据，准确高效地筛选分类特征基因是数据分析的重要工作。通过 制备常温状态和低温状态两类地方民猪样本的基因芯片数据，以抗寒性状相关基因筛选为目的，提出目标风 险最小特征搜索算法，通过设定目标参数筛选出抗寒性状相关的基因集合。这些抗寒性状相关基因对两类样 本分类效果非常好，通过与经典的分类方法相比较，多种方法都获得稳定高效的分类准确率，该特征筛选过程 获得的抗寒相关基因具有较强的分类效能。通过基因功能生物学注释，得到特征基因所在的功能结点信息， 这些已知基因的功能为进一步研究特征基因集合中未知基因的功能提供了试验设计依据。目标风险最小特 征搜索的同时可以进行样本分类和重要分类特征的筛选，适用于基因表达谱数据的统计分析。 关键词 基因芯片；特征搜索；抗寒；分类效能；目标风险最小特征算法 中图分类号 S813．3 文献标志码 A 文章编号 1004—1389(2013)10—0015一07 Ibr Genesin with ScreeningAnti—fteezingPig Target Risk—minimized Feature-searchingAlgorithm YANG andLIUDi4 Yueyin9123 (1．Postdoctoral of Sciences，Harbin Programme，Heilon由iangAcademyAgricultural 150086，China；2．PostdoctoralProgramme， Northeast ofScience，Northeast ForestryUniversity，Harbin150040，China；3．College Ag“culturalUniversity，Harbin of 150030，China；4．HeiIon鲥iangAcademyAg“culturalSciences，Harbin150086，China) Abstract thecharacteristicsofsmall of andefficient data，accurate Facing samplegenechip screening classificationfeatureisan workfor data Basedonthenormaltem— microarray gene important analysis． stateandc01dstateinduced the risk—mi