试验一组织和白细胞中基因组dna的提取.docVIP

试验一组织和白细胞中基因组dna的提取.doc

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实验一 组织和白细胞中基因组DNA的提取 目的 掌握真核生物基因组DNA的提取方法。 原理 高产量和高纯度的真核生物DNA分离技术是进行PCR、Southern杂交、DNA文库构建,及许多其它分子生物学研究的前提条件。真核生物基因组DNA位于细胞核内,与细胞核蛋白结合在一起。要提取真核细胞基因组DNA,必须去除与核酸结合的蛋白质、多糖、脂类以及RNA等生物大分子。采用组织匀浆法破碎细胞,在SDS和EDTA溶液中,以蛋白酶K消化细胞的蛋白质。该方法虽然传统、简单,但却行之有效;不仅实验操作具有相当大的灵活性,而且不需昂贵的仪器设备。其中SDS能破坏核膜使DNA释放入水溶液,还可破坏细胞膜上的脂肪和蛋白质,并与蛋白质结合成复合物从而使蛋白质变性沉淀;EDTA螯合Mg2+, Ca2+等金属离子,抑制DNA酶对DNA的降解作用。这样大分子DNA在乙醇中便以絮状物析出,离心沉淀后再用70%的乙醇洗涤除盐,干燥后溶于TE或双蒸水中。以此法制备的DNA大小一般为40~150kb。 仪器材料 (一)仪器 1.恒温水浴锅(北京医疗设备厂,型号:BS2-I) 2.高速离心机(Hema,型号:TGL-16H) 3.冷冻高速离心机(珠海黑马医学仪器有限公司,型号:TGL-18R) 4.-20℃冰箱(海尔集团青岛电冰柜总厂 型号:BD-198S) 5.液氮罐(成都液氮容器厂,型号:YDS-35-125) 6.匀浆器 7.自动制冰机 (意大利SCOTSMAN公司 型号:AF-10) (二)材料 1. 动物或人的组织标本 2. 人的血液标本 试剂 1. DNA抽提缓冲液: 1.0 mol/L Tris-HCl (pH8.0) 50 ml 0.5mol/L EDTA (pH8.0) 2.0 ml 1.0M NaCl 100ml 10% SDS 50 ml 水 298ml 2.液氮 3.蛋白酶K(20mg/ml):0.2g蛋白酶K溶于10ml水中。工作浓度100-200μg/ml。 4.平衡酚 5.氯仿 6.3M乙酸钠(pH4.8):称取40.81g三水乙酸钠溶于80.0ml水中,用冰乙酸调节pH值至4.8,定容至100ml。 7.预冷的100%乙醇 8.预冷的70%乙醇 9. 预冷的0.01M的PBS 五、方法 (一) 组织细胞基因组DNA的提取 1. 取新鲜组织或冰冻组织块0.3-0.5cm3,尽量剪碎,加DNA抽提缓冲液400μl,在组织匀浆器中匀浆至不见组织块,转入1.5ml Ep管中,用100μl DNA抽提缓冲液冲洗匀浆器,冲洗液一并转入Ep管中。 2. 加入蛋白酶K至终浓度100-200μg/ml,混匀后放于37℃水浴5-12h,中间振摇数次。 3. 加500μl(等体积)平衡酚,颠倒混匀30s,10,000rpm离心1min,小心取出上层水相450μl,移入一新的Ep管,必要时重复抽提一次。 4. 向水相管中加入500μl氯仿,颠倒混匀30s,10,000rpm离心1min。 5. 小心取出上层水相400μl,移入另一新的Ep管,加入60μl 3M NaAc(pH4.8)和1000μl的冰无水乙醇,轻轻颠倒混匀,即可见或多或少的云絮状漂浮物。-20℃放置2h。 6. 以14,000rpm冷冻离心15min,轻轻弃去上清,用预冷的70%乙醇洗涤沉淀。 7. 待沉淀干燥后,加适量的TE或双蒸水溶解,-20℃或4℃保存备用。 8. 取5μl DNA溶液溶于495μl双蒸水中,混匀,测定其在260nm和280nm处的吸光度值。 DNA含量(?g/?l)=A260×5 (二)白细胞基因组DNA的提取 1. 收集5~10ml抗凝血,3000rpm离心10min,弃去上层淡黄色的血浆,小心吸取白细胞层。 2. 用双蒸水洗涤白细胞,使混杂的红细胞溶血,3000rpm×10min离心数次,以去除红细胞。 3. 收集白细胞沉淀,以适量双蒸水或PBS重悬白细胞,移入1.5ml的离心管中,每管0.25ml。 4. 加入等体积(0.25ml)的2×DNA抽提缓冲液,加蛋白酶K至终浓度100~200μg/ml,混匀后放于37℃水浴2~5h。 5. 加500μl(等体积)平衡酚,颠倒混匀30s,10,000rpm离心1min,小心取出上层水相450μl,移入一新的1.5ml Ep管,必要时重复抽提一次。 6. 向水相管中加入500μl氯仿,

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