实时荧光定量pcr法检测环境假单胞菌属细菌丰度-东南大学学报.pdfVIP

第３６卷第１期 东南大学学报（自然科 学版 ） Ｖｏｌ３６ Ｎｏ１ 　 ２００６年１月 ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＳＯＵＴＨＥＡＳＴＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ） 　 Ｊａｎ．２００６ 　　　　　　 实时荧光定量ＰＣＲ法检测环境假单胞菌属细菌丰度 １ １ １ １ ２ ２ 赵传鹏　 浦跃朴　 尹立红　 梁戈玉　 吕锡武　 李先宁 １ （东南大学公共卫生学院，南京２１０００９） ２ （东南大学土木工程学院，南京２１００９６） 摘要：应用实时荧光定量ＰＣＲ法，建立了总细菌及假单胞菌属的标准曲线，并以环境样本中假 单胞菌属与总细菌的比值反映其细菌丰度．应用该方法评价人工除藻反应器中组合填料、无纺 布、弹性填料等介质对太湖水中溶藻细菌之一的假单胞菌属的富集情况．结果显示：该方法对总 ３ ８ ２ ５ 细菌的检测范围为１０～１０个基因拷贝／Ｌ（Ｒ ＝０９９７）；假单胞菌属的检测范围为１～１０个 μ ２ 基因拷贝／Ｌ（Ｒ ＝０９９４）．对除藻反应器溶藻细菌富集效果的评价显示，所建立的方法能有效 μ 检测反应器中填料对该类溶藻细菌的富集程度．初步证明所建立的方法可有效定量假单胞菌属 在环境样本中的丰度． 关键词：实时荧光定量ＰＣＲ；假单胞菌属；人工介质；溶藻细菌 中图分类号：Ｘ１７２　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００１－０５０５（２００６）０１０１４３０４ ＤｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆａｂｕｎｄａｎｃｅｏｆＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｉｎｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｓａｍｐｌｅｓ ｂｙｒｅａｌｔｉｍｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＰＣＲ １ １ １ １ ２ ２ ＺｈａｏＣｈｕａｎｐｅｎｇ　 ＰｕＹｕｅｐｕ　 ＹｉｎＬｉｈｏｎｇ　 ＬｉａｎｇＧｅｙｕ　 ＬüＸｉｗｕ　 ＬｉＸｉａｎｎｉｎｇ １ （ＳｃｈｏｏｌｏｆＰｕｂｌｉｃＨｅａｌｔｈ，ＳｏｕｔｈｅａｓｔＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ２１０００９，Ｃｈｉｎａ） ２ （ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＣｉｖｉｌＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＳｏｕｔｈｅａｓｔＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ２１００９６，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＡｒｅａｌｔｉｍｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＰＣＲ（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ）（ＲＴＱＰＣＲ）ｍｅｔｈｏｄｉｓｅｓｔａｂ ｌｉｓｈｅｄｔｏｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｌｙｄｅｔｅｃｔｔｈｅａｂｕｎｄａｎｃｅｏｆａｌｇｉｃｉｄａｌｂａｃｔｅｒｉａｏｆＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｉｎｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ｓａｍｐｌｅｓｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙ．ＴｈｅｓｔａｎｄａｒｄａｂｕｎｄａｎｃｅｃｕｒｖｅｓｏｆｔｏｔａｌｂａｃｔｅｒｉａａｎｄＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｗｅｒｅｅｓｔａｂ ｌｉｓｈｅｄｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙａｎｄｔｈｅａｂｕｎｄａｎｃｅｏｆＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓｗａｓｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｄｂｙｔｈｅＣｒａｔｉｏｏｆＰｓｅｕｄｏ ｔ ｍｏｎａｓａｎｄｔｏｔａｌｂａｃｔｅｒｉａ．Ｔｈｅａｂｕｎｄａｎｃｅｏｆａｌｇ