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微生物网上自动化鉴定系统 刘澎涛 马俊才 蔡妙英 (中国科学院微生物研究所，北京100080) 摘要本鉴定系统中从细菌在整个生物界地位开始包括的各类群展开，以系统 细菌学为原理，并以肠杆菌科和高温放线菌为实例，说明自动化鉴定系统的生 成。该系统主要包括细菌通用培养基、培养方法、细菌性状编码、属和种的描述 及与之相关的细菌名称等各种数据库，因此在本系统中，针对肠杆菌科所包含的 30个属、123个种做示例，可以通过多种途径进行查询。 关键词肠杆菌 数据库微生物自动鉴定系统(MAIS) 生物分类学一般被认为是一门古老的学科。但在近年来，由于各边缘学科(电子显微 镜、化学分析、分子生物学)等的渗入，使分类学发展进入新的里程碑。现代的科学，由于 电子学的迅速发展改变了面目，具体到分类学如何与电子学相结合才能有飞跃的发展。 本鉴定系统中从细菌在整个生物界地位开始；从所包括的各类群展开，并以肠杆菌科 和高温放线菌为实例，说明自动化鉴定系统的生成。这将给以后各类菌群的自动化鉴定 系统的建立奠定基础。 本系统主要包括细菌(肠杆菌科)、放线菌、培养方法及与之相关的细菌和放线菌名称 等各种数据库。当然放线菌归属真细菌的第22～29群，由于它们与其他真细菌形态差异 较大和传统鉴定方法较为定型，因此在本系统中，针对肠杆菌科所包含的30个属、123个 种做示例，可以通过多种途径进行查询。 一、从细菌的分类层次特征开始检索，到类群、亚群、科、属，最后到种，共分为7个步 骤：(包括细菌的4个类别，35个群) 步骤一选择“细菌的类别” 显示：I细胞壁呈革兰氏阴性反应的真细菌。 II细胞壁呈革兰氏阳性反应的真细菌。 III没有细胞壁的真细菌。 菌和真核生物。生存于极端环境和水生环境中。 步骤二选择“细胞壁呈革兰氏阴性反应的真细菌” 根据以上4条类别的描述，选出符合您自己的要求类别，本示例肠杆菌科符合类别 I，单击“细胞壁呈革兰氏阴性反应的真细菌”后，便会出现它所包含的以下11个类群，在 这些类群中，肠杆菌科属于第5类群， 显示：GROUP1螺旋体 GROUP 2好氧／微好氧运动的螺旋状／弧状G一细菌 · · 148 GROUP 3不动(或罕见运动)G一弯曲杆菌 GROUP4G一好氧／微好氧的杆菌和球菌 GROUP 5兼性厌氧G一杆菌 GROUP6G一厌氧直、弯和螺旋体状杆菌 GROUP 7消化硫酸盐或还原硫细菌 GROUP 8厌氧G一球菌 GROUP9立克次氏体和衣原体 GROUP 10厌氧的光合细菌 GROUP 11好氧化能自养菌和有关菌 步骤三选择“兼性厌氧G一杆菌” 显示：兼性厌氧G一杆菌 化能异养菌，但也有的可用H2作为电子供体而自营养生活。不形成附着物、柄、鞘 或气泡，不滑动，不芽殖，在大气中营呼吸代谢，也能以发酵营厌氧生活。游离生活或与 人、动物或植物寄主中共生。有的可致病。 GROUP5FACULTAIVEANAEROBICGRAM—NEGATIVEROODS ANAEROBICGRAM—NEGATIvEROODS” 步骤四 选择“FACULTAIvE 显示：第5群所包含的各属： GROUP5FACULTAIVEANAEROBICGRAM—NEGATIVER00DS 1 Enterobacteriaceae SUBGROUP Family Genus GenusBudvic