铁锰结核土壤锰氧化细菌多样性及新菌属分析.pdfVIP

土 壤 (Soils), 2012, 44 (4): 606-612 铁锰结核土壤锰氧化细菌多样性及新菌属分析① 1 2 1* 1 2 杨伟红 , 张 震 , 李 林 , 张忠明 , 刘 凡 （1 农业微生物学国家重点实验室（华中农业大学），武汉 430070 ； 2 农业部亚热带农业资源与环境重点实验室（华中农业大学），武汉 430070 ） 摘 要： 尽管细菌的锰氧化作用被认为是自然界中氧化锰矿物形成的主要成因，但目前国内外对陆地土壤环境中锰氧化细 菌的种群组成与多样性方面的研究甚少。本研究对采集于山东崅峪一处含铁锰结核的棕壤进行了可培养锰氧化细菌分离、活性 测定与多样性调查，结果发现表层土壤（A 层：0 ~ 20 cm ）的可培养锰氧化细菌是最丰富的，但是高锰氧化活性的细菌主要分 布在心土层（B 层：20 ~ 40 cm ）和底土层（C 层：＞75 cm ）。通过对具有高锰氧化活性的分离菌株 16S rRNA 基因的扩增、测 序和序列 BLAST 比对分析，发现了7 个此前未见报道的具有锰氧化活性的新菌属。此外，对 5 株具有高锰氧化活性的分离菌株 和土壤样品的进行了 16S rRNA 基因 V3 产物的变性梯度凝胶电泳（DGGE ）分析，结果显示此5 株高锰氧化菌株并非都是土壤 中的高丰度细菌。 关键词： 锰氧化细菌；新菌属；多样性；铁锰结核土壤；16S rRNA 基因 中图分类号： Q939.96 锰氧化细菌（Manganese-oxidizing bacteria ）是一 菌主要分离于海洋和淡水环境，而陆地土壤环境的锰 类可将 Mn(II) 氧化成 Mn(III) 或 Mn(IV) 型高锰氧化 氧化细菌由于大多被土壤颗粒所吸附，对其进行分离 [1] 矿物、且在系统发育上呈现较大多样性的细菌类群 。 和在实验室培养成纯培养菌落，要比水相系统中的锰 锰氧化物是环境中一种高活性的矿物，具有很强的氧 氧化细菌复杂[3] ，因而被报道得比较少。 化和吸附作用，决定着环境中许多物质的形态、迁移 土壤铁锰结核（锰氧化物）是土壤中重要的新生 和转化，在元素生物地球化学循环中起着重要的作用 体，是主要在微生物作用下形成的一定时期的土壤产 [2] 。研究发现锰氧化细菌主要是分布于低 GC 含量的 物。理论上铁锰结核土壤中应存在具有锰氧化活性的 革兰氏阳性菌、放线菌及分别属于 α-、β- 和 γ-变形菌 不同细菌类群，因而是研究土壤锰氧化细菌群落与多 亚纲（Proteobacteria ）等的细菌类群[3] 。迄今，对分 样性、并研究这些细菌在氧化锰矿物形成过程中所起 离于浅海沉积物或海水环境的 3 种锰氧化细菌，即芽 作用的良好材料。本研究以山东崅峪一处富含铁锰结 孢杆菌 Bacillus sp. SG-1、恶臭假单胞菌 （Pseudomonas 核的棕壤为研究对象, 调查了不同土层中锰氧化细菌 putida ）MnB1 和 GB-1 、生盘纤发菌（Leptothrix 的群落多样性，确定了从中所分离的 7 个此前未见报 - discophora ）SS-1 和 SP-6[4 7] 的研究是较为深入的，已 道的锰氧化细菌新菌属，可为土壤细菌的锰氧化作用 被认同为研究细菌锰氧化作用的 3