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第16卷第4期 中国水产科学 Vol.16 No.4
2 0 0 9 年 7 月 Journal of Fishery Sciences of China J u l y 2 0 0 9
条斑紫菜半胱氨酸合成酶基因的电子克隆与分析
1 1 1 2
易乐飞 ,王萍 ,周向红 ,刘楚吾
(1.淮海工学院 江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏 连云港 222005;2.广东海洋大学 水产学院,广东 湛江 524088)
摘要 :从网络共享的条斑紫菜( Ueda)表达序列标签(expressed sequence tag,EST)数据库检索出与拟南芥
Porphyra yezoensis
( )半胱氨酸合成酶(cysteine synthase, )基因高度相似的EST序列,构建EST叠连群(contig),并依据
Arabidopsis thaliana CSase
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contig 设计引物。提取条斑紫菜叶状体总RNA,采用RT PCR方法,扩增得到了条斑紫菜半胱氨酸合成酶基因( )
PyCSase B
-
的cDNA序列(GenBank accession:FJ232911)。该cDNA序列含有长1 152 nt的完整开放阅读框,编码产物(PyCSase B)的分
- -
子量39.3 kD,长383 AA。PyCSase B的N端前60个氨基酸残基构成了叶绿体转运肽序列,成熟的PyCSase B定位在叶绿体
-
中。PyCSase B与紫红紫菜( )、莱茵衣藻( )、拟南芥和水稻( )的序列一致性
P. purpurea Chlamydomonas reinhardtii Oryza sativa
- -
分别为94%、69%、64%和65%,进化树显示PyCSase B在进化上处在细菌和高等植物之间。PyCSase B含有与5′-磷酸吡
哆醛(Pyridoxal 5′-phosphate)和 -乙酰丝氨酸( -acetylserine)结合的保守氨基酸残基
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