语义万维网在医疗和生命科学领域的应用-科学网.pdfVIP

专题 第 6 卷  第 8 期  2010 年 8 月 语义万维网 在医疗和生命科学领域的应用 陈华钧1 谢国彤2 潘 越2 1浙江大学 关键词 ：生命科学 电子医疗 本体 2IBM中国研究院 医疗和生命科学领域的迅猛发展产生了海量 Consortium ，万维网联盟）建立了一个医疗和生命 [8] 的医学数据，这些数据形成了有关疾病、药物、基 科学的语义万维网工作组 。这个工作组的突出贡 因、蛋白质和化学组成物以及病人记录等各方面的 献有两个，一个是关注药物发现的开放互联药物 [9] 领域知识。基于医疗与生命科学领域的研究及发展 数据 （Linked Open Drug Data ，LODD ）项目 ，另 现状，建立能够对上述海量信息提供数据整合和集 一个是转化医学本体项目（Tr an slational Medicine [1~2] [10] 成化知识分析的网络架构平台显得尤为重要 。语 Ontology Proj ect ，TMOP ） 。LODD 的目标是将药 [3] 义万维网 作为下一代互联网的重要技术走向，对 物、中医药、病例诊断、疾病和制药公司整合成 于提高医疗与生命科学领域知识共享和科学协作自 一个开放数据网络平台。到目前为止，该项目已 动化具有重要的意义。 经包含了8400万个RDF数据项和388000条外部数 语义万维网是万维网的扩展与延伸。在这样 据资源的语义链接。TMOP则把关注点放在制药产 的网络中，信息都被赋予了明确的含义，机器能够 业的高层次的以病人为中心的本体建模。转化医 自动处理和集成网上可用的信息。语义万维网使用 学本体可以让制药公司建模并整合以病人为中心 1 2[4] XML 来定义定制的标签格式，使用RDF 的灵活性 的信息，查询药物信息，提高研制特殊用途药物 来表达数据语义，使用OWL3[5]万维网本体语言来描 的效率。 述万维网术语的明确含义和它们之间的关系。它的 总的来说，语义万维网技术在医疗和生命科学 主要变革动力是使数据更加便于计算机处理和查 领域的价值可以概括如下： 找，其最终目标是使计算机在海量的网络资源中 开放数据关联的网络效应促进医疗领域的 更加便利地找到用户需要的信息，从而将万维网 数据互联 语义万维网技术提供的以关联为核心的 中一个个现存的信息孤岛发展成一个巨大的全球 数据模型降低了数据互联的门槛。特别地，语义万 共建的知识库。 维网的架构和其语义映射的思想使得对于现存的 语义万维网在生命科学和医疗领域的应用体 系统并不需要作大的修改就可以完成网络数据的转 现出它的巨大发展潜力[6~7] 。W3C （World Wide Web 换。另外，由于其去中心化的本质和互联网上的社 1 Extensible Markup Language，可扩展标记语言 2 Resource Description Framework，一种用于描述万维网资源的标记语言 3 Web Ontology Langu