甘蔗细胞质型苹果酸脱氢酶基因的克隆及其表达分析-热带亚热带植物.pdfVIP

热带亚热带植物学报　2012 ，20(5) ：455~461 Journal of Tropical and Subtropical Botany 甘蔗细胞质型苹果酸脱氢酶基 因的克隆及其表达 分析 a a b c a a a 徐景升, 阙友雄, 颜克伟 , 唐唯其 , 许莉萍, 高三基, 郭晋隆, 董萌a a* , 陈如凯 (福建农林大学, a. 农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室, 甘蔗综合研究所；b. 生命科学学院；c. 水稻遗传研究所, 福州 350002) 摘要： 对甘蔗(Saccharum officinarum L.) 叶片全长 cDNA 文库进行测序 ，获得 了 1 个细胞质型苹果酸脱氢酶(cMDH)基 因的全 长 cDNA 序列 ，命名为 - 。生物信息学分析表 明，该基 因全长 1314 bp ，开放 阅读框为 999 bp ，编码 332 个氨基酸。Sc- Sc cMDH cMDH 与其他植物 cMDH 的氨基酸序列 同源性高达 86.5%~97.0%。Sc-cMDH 包含典型的 NAD+ 结合基元 T11GAAGQI17 和催 化基元 I184WGNH188 ，还有相 当保守 的 6 个半胱氨酸残基 ，因此推断该基 因为细胞质型 NAD-MDH 。定量 PCR 分析结果表 明， 该基 因在甘蔗叶片和根 中的表达量高于茎 。 关键词： 甘蔗 ；细胞质型苹果酸脱氢酶基 因；实时定量 PCR doi: 10.3969/j .issn.1005–3395.2012.05.005 Cloning and Expression Analysis of Cytosolic Malate Dehydrogenase Gene from Sugarcane a a b c a a XU Jing-sheng , QUE You-xiong , YAN Ke-wei , TANG Wei-qi , XU Li-ping , GAO San-ji , GUO Jin-longa a a* , DONG Meng , CHEN Ru-kai (a. Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Ministry of Agriculture; Institute of Sugarcane; b. College of Life Science; c. Institute of Rice Genetics, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China) Abstract: A full-length cDNA sequence of sugarcane (Saccharum officinarum L.) cytosolic malate dehydrogenase (cMDH) gene, named as - , was obtained from sugarcane full-length cDNA library by EST sequencing Sc cMDH and bioinformatics analysis. The full-length of - was 1314 bp with 999 bp open reading frame, encoding Sc cMDH 332 amino acids. Sc-cMDH shared 86.5%~97.0% of amino acids with cMDH from other 9 species. Sc-cMDH contains typical NAD+ binding motif (T11GAA