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第八章 模式生物 本 章 内 容 一、模式生物：概念、特点 二、模式生物基因组计划：缘起、进展 三、模式生物基因组研究技术 四、家蚕的模式生物化 第一节 模式生物 （一）概念 早在20世纪最初的20年中，甚至更早以前，人 们就发现，如果把关注的焦点集中在相对简单的生 物上，则发育的现象难题可以得到部分解答。因为 这些生物的细胞数量更少，分布相对单一，变化也 较好观察。 由于进化的原因，细胞生命在发育的基本模式方 面具有相当大的同一性，故利用位于生物复杂性阶梯 较低级位置上的物种来研究发育共通规律是可能的。 尤其是当在有不同发育特点的生物中发现共同形态形 成和变化特征时，发育的普遍原理也就得以建立。 生物学家为了研究的方便和可行， 选用的一些特定的物种或者有别于研究 主体的生物。 对这些生物的研究能够帮助我们理 解生命世界一般规律的意义，故称之为 “模式生物”。 原始生命 （二）特点 生活周期短,遗传背景清楚,易于培养和繁殖 容易进行实验操作,特别是遗传学分析 生理特征能够代表生物界的某一大类群 基因组相对于人的基因组小、结构简单 [酿酒酵母] Saccharomyces cevevisiae 真核生物中的 “大肠杆菌”，研究真核生物生命现象的首选工具 基因组大小：15Mb；6000个基因 特点:1)最简单的真核单细胞生物,可在基本培养基上生长,生长可完全控制 2)在单倍体和二倍体的状态下均可生长,可在实验条件下控制单倍体和 二倍体之间的相互转换,这对其基因功能研究十分有利 3)近31%编码蛋白质的基因或ORF与哺乳动物编码蛋白质的基因高度同源 [秀丽隐杆线虫]nematode, Caenorhaditis elegans 主要用于发育研究；RNAi 基因组大小：100Mb；1.9万个基因 特点:1)通身透明,长不过1mm 幼虫:556个体细胞 2)身体中所有细胞能被逐个盘点并各归其类 2个原始生殖细胞 3)生命周期短(3.5d),可不间断观察并追踪每个细胞的演变 成虫:959个体细胞 2000个生殖细胞 4)把线虫浸泡到含有核酸的溶液中可实现基因导入 [黑腹果蝇]fruit fly, Drosophila melanogaster 主要用于遗传和发育研究 基因组大小：117Mb；1.3万个基因 特点:繁殖迅速(7-10d),饲养简单,观测容易,易于进行基因敲除和定位等 [斑马鱼]zebrafish 脊椎动物中的 “果蝇” 基因组大小：1500Mb； 特点:1)个体小,繁殖力强,生长速度快,体外受精和发育,胚胎透明,易养殖 2)内脏器官、血液、神经中枢和视觉系统在分子水平上与人类相似程度达85% [小鼠]mouse 生物医学研究中广泛使用的模式生物 基因组大小：3000Mb；3万个基因 17世纪开始用于解剖学和动物实验,是当今研究最详尽的哺乳类实验动物. 80％的基因与人类基因相同/同源。 第二节 模式生物基因组计划 （一）缘起 （1）美国 “肿瘤计划”的搁浅 （2）科学家的胆略 诺奖获得者杜伯克1986年3月发表于《Science》的短文 《肿瘤研究的转折点：人类基因组测序 》中指出： “如果我们想更多地了解肿瘤，我们从现在起必须关注细胞 的基因组。…… 从哪个物种着手努力？如果我们想理解人类 肿瘤，那就应从人类开始… … 。人类肿瘤研究将因对 DNA 的详细知识而得到巨大推动。” 1984.12 犹他州阿尔塔组织会议，初步研讨测定人类整个基 因组DNA序列的意义 1986 杜伯克在 《Science》撰文 “肿瘤研究的转折点:人 HG