生化 02(蛋白质).ppt

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生化 02(蛋白质)

常见的组合形式:αα、βαβ、ββ αα (左手超螺旋) βαβ单元 ββ(β发夹) β曲折 βαβαβ(Rossmann折叠) (2)结构域 多肽链在二级结构或超二级结构的基础上,进一步卷曲折叠成为相对独立、近似球形的组装体称为结构域(structure domain),是三级结构的局部折叠区,平均为100AA残基。 (M/H?) 结构域与蛋白质的功能密切相关,许多多结构域的酶,其活性中心都位于结构域之间。结构域之间常常只有一段肽链相连,形成所谓“铰链区”(hinge region),使结构域容易发生相对运动。结构域之间的这种柔性(flexibility),有利于酶和抗体活性的发挥。 4.三级结构 多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上,主链构象和侧链构象相互作用,进一步盘曲折叠形成特定的球状分子结构,称作蛋白质三级结构(tertiary structure) 。 三级结构是指多肽链中所有原子的空间排布。 肌红蛋白(myoglobin) 5.四级结构 由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成的特定三维结构(构象)称为蛋白质的四级结构(quarter-nary struc-ture)。涉及亚基的种类、数目和亚基的空间排布,包括亚基间的接触位点和相互作用关系,但不包括亚基本身的构象。 同/杂多聚蛋白质 α-亚基(α- subunit) 血红蛋白(hemoglobin) β -亚基(β- subunit) 血红素 (haem) 烟草花叶病毒(TMV)示意图 由2 130个相同亚基构成的螺旋对称性柱形蛋白质外壳,紧密排列于一含有 6 390个核苷酸的单链RNA分子周围。解离的TMV外壳亚基和RNA,在合适的条件下能自装配成完整的TMV。 6.稳定蛋白质高级结构的作用力 四、蛋白质结构与功能的关系 (一)蛋白质一级结构与功能的关系 (二)蛋白质高级结构与功能的关系 1. 一级结构变异与生物进化 在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质,称为同功能蛋白质。 它们的氨基酸序列具有明显的相似性,这种现象称为序列同源,有明显序列同源的蛋白质,也称同源蛋白质。 (一)蛋白质一级结构与功能的关系 (1)同源蛋白质完全相同的氨基酸残基,称不变残基,它们决定了蛋白质的空间结构与功能。 (2)同源蛋白质有相当大变化的氨基酸残基,称为可变残基,它们的差异体现了种属特异性。 因此,对不同生物来源的同功能蛋白质的一级结构进行比较研究:①可以帮助我们了解某些氨基酸对其活性重要性;②还可为生物进化提供新的可靠依据氨基酸序列差异越大,种间亲缘关系越远。 同源蛋白质结构的种属差异与保守性 2.一级结构变异与分子病 (1)分子病 基因突变 AA变异 蛋白结构和功能改变引起的遗传病。 (2)镰刀状红细胞贫血病 由Hb分子(1/574AA)β亚基N末端序列的一级结构改变引起Hb表面电荷和等电点变化,溶解度降低并出现不正常线形缔合。 NH2- NH2- 蛋白质结构层次 一级结构(primary structure) 二级结构(secondary structure) 超二级结构(supersecondary structure) 结构域(structural domain) 三级结构(tertiary structure) 四级结构(quarternary structure) 蛋白质结构层次 (一)蛋白质的一级结构 概念:多肽链上各种氨基酸残基的排列顺序,即氨基酸序列称为蛋白质的一级结构(primary structure)。 (51Aa,5 733 u) 1.肽和肽键 (1)肽 由氨基酸构成的线形聚合物称为肽(peptide)。二个氨基酸分子缩合而成的肽,可将其称为二肽(dipeptide)。依次类推。 N H α C O C α N H α C O C OH H H R1 R2 H 肽键氮氧原子共振产生:①部分双键性质;②多肽主链酰胺平面;③Cα处于顺式或反式构型;(以上为肽单位平面原则)④二面角;⑤偶极性(N末端,C末端)。酰胺平面 6 原子是主链骨架的重复单位,称肽单位。 多肽链(polypeptide chain):是许多肽单位(peptide unit)通过 Cα连接而成的线型聚合物。 (2)肽键(peptide bone) 氨基酸残基 H OH 蛋白质多肽链中由肽键连接的

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