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第8章真核基因表达的调控
第八章
真核基因表达的调控;1. 真核生物的基因组
2. 真核生物基因表达调控的特点和种类
3. 真核生物DNA水平上的基因表达调控
4. 真核生物转录水平上的基因表达调控
5. 真核基因转录后水平上的调控;1. 真核生物的基因组; 原核生物基因组结构特点;1.2 基本概念;Organization of histone genes in the animal genome; ; ; 外显子与内含子的可变调控
组成型剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的mRNA。
选择性剪接:一个基因的转录产物由于不同的剪接方式而形成不同的成熟mRNA。;2 真核生物基因表达调控的特点和种类
2.1 真核基因表达调控的特点
RNA聚合酶种类多
多层次调节
个体发育机制复杂
活性染色体结构变化
以正调节为主
转录与翻译不耦联
存在转录后修饰、加工机制 ;2.2 真核生物基因表达调控的种类
根据性质可分为两大类:
(1)瞬时调控或称为可逆性调控:相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应。瞬时调控包括某种底物或激素水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。
(2)发育调控或称不可逆调控:是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。;3 真核生物DNA水平上的基因表达调控;3.1 基因丢失
在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些基因的活性。某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在个体发育中,许多体细胞常常不可逆地丢失掉整条或部分染色体。只有将来分化产生生殖细胞的那些细胞,才一直保留着整套染色体。目前,尚未在高等真核生物(包括动物、植物)中发现类似的基因丢失现象。;3.2 基因扩增
基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性增大的现象,它使得细胞在短期内产生大量的基因产物以满足生长发育的需要,是基因活性调控的一种方式。; 基因组拷贝数增加,即多倍性,在植物中是非常普遍的现象。基因组拷贝数增加使可供遗传重组的物质增多,这可能是加速基因进化、基因组重组和最终物种形成的一种方式。
在发育或系统发生中的倍性增加现象在植物中普遍存在。;3.3 基因重排
通过调整有关基因片段的衔接顺序,使之重排成为1个完整的转录单位,例如将一个基因从远处移至距启动子很近的位点从而有效启动转录,这种方式被称为基因重排。
通过基因重排调节基因活性的典型例子是免疫球蛋白结构基因的表达。; Ig有2条相同的重链和轻链。恒定区和可变区分别由不同的DNA基因片段所编码。不同区的重排和连接是产生抗体多样性的分子基础。;;3.4 DNA的甲基化与基因调控; CpG岛:成串出现在DNA上的CpG二核苷酸序列。; DNA甲基化抑制基因转录的机理
DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,抑制了转录因子与启动区DNA的结合效率。主要是不利于模板DNA与RNA聚合酶的结合。;图7-14 DNA甲基化对基因转录的抑制作用; 没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C。已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法被区分。因此, CpG序列极易丢失。
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失,所以,高等真核生物中CG序列远远低于其理论值。哺乳类基因组中约存在4万个CG 序列,大多位于转录单元的5′区。; 人类X染色体失活调控的机制 ;3.5 染色质的结构与基因表达调控; 常染色质:结构松散,基因表达。
异染色质:结构紧密,基因不表达。
有基因表达活性的染色质DNA对DNaseⅠ更敏感,即,对DNaseⅠ的敏感性可作为该基因转录活性的标志。
活性染色质上具有DNaseI超敏感位点。每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5′端启动子区域。; 染色质是否处于活化状态是决定RNA聚合酶能否有效行使转录功能的关键。
活性染色质往往具有疏松的结构,从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合,及便于RNA聚合酶在转录模板上滑动。; 在转录过程中,在RNA聚合酶前方消除核小体结构,而在RNA聚合酶后方,再重新形成核小体。;真核RNA Pol Ⅱ转录的基因;4.1 真核基因转录起始复合物的组成; 启动子:RNA聚合酶能够识别、结合并导致转录起始的DNA序列。真核基因启动子包含转录起始位点附近的DNA序列及启动转录所必需的一些顺式作用元件, 这些元件被反式作用因子所识别和结合。; 真核RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ为寡聚酶,每种酶分子含2个大亚基和4~8个小亚基,分子量在500 KD左右。;4.2.1 真核rRNA基因启动子与RNA聚合酶
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