水茄泛素结合酶E2基因StUBCc的克隆及黄萎病菌诱导表达分析.pdfVIP

园艺学报，2015 ，42 (6) ：1185 –1194. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0151；http ：//www. ahs. ac. cn 1185 水茄泛素结合酶 E2 基因 StUBCc 的克隆及黄萎 病菌诱导表达分析 * * 刘炎霖，陈钰辉 ，刘富中，张 映，连 勇 （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081 ） 摘 要：以茄子近缘野生种水茄（Solanum torvum Swartz ）幼苗根部为试材，并以黄萎病菌（大丽轮 枝菌，Verticillium dahliae Kleb ）处理的水茄的抑制差减文库中差异表达的EST 片段 F290 为基础，利用 RACE 技术，获得一个756 bp 的cDNA 全长序列。经生物信息学分析发现该序列为泛素结合酶E2-2（UBC2 ） 载体蛋白同源基因，命名为 StUBCc ，GenBank 登录号为 KP330492 。StUBCc 基因编码区共 459 bp ，编码 152 个氨基酸，该蛋白分子量为 63.0925 kD，等电点为 5.13 。采用MEGA 5 软件对 StUBCc 和其他同源蛋 白的氨基酸序列比对，结果表明其与葡萄的同源蛋白一致性最高，达 99%，有很高的功能区段保守性。 采用荧光定量 PCR 对黄萎病菌侵染不同时间的水茄幼苗根部 StUBCc 基因的表达量进行测定，发现在侵 染 6 h 后，表达量最高，为对照（无菌水处理）的 6.79 倍。 关键词：水茄；StUBCc ；基因克隆；表达分析 中图分类号：S 641.1 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2015 ）06-1185-10 Cloning and Expression Analysis Induced by Verticillium Wilt Fungus of Ubiquitin-conjugating Enzyme Gene StUBCc from Solanum torvum * * LIU Yan-lin ，CHEN Yu-hui ，LIU Fu-zhong ，ZHANG Ying ，and LIAN Yong （Institute of Vegetables Flowers ，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081，China） Abstract ：An EST F290 was from suppression subtractive hybridization library made from pathogen treated roots of the seedling roots of verticillium wilt （Verticillium dahliae Kleb ）resistant Solanum torvum Swartz. A full length cDNA （756 bp ）was obtained using rapid amplification of cDNA ends （RACE ） technology ，which encoded the ubiquitin-conjugating enzyme E2-2 （UBC2 ）family gene and was designated as StUBCc. GenBank number is KP330492. The putative protein contains of 152 amino acids with a molecular weight of 63.0925 kD and a theoretical pI of 5.13. Multiple sequence alignment of the amino acid