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RHEL5下利用MPICH2配置并行运算集群 　　摘 要:MPICH是国内常用的集群计算消息传递系统。本文描述了MPI的基本概念及实现软件MPICH2,介绍了在Linux环境下如何构架基于MPICH的高性能计算集群系统的方法,给出了具体的步骤和基本配置过程。实验结果表明:在现有并行集群系统下能有效地利用现有计算机资源,大幅度提高计算效率,为一些复杂问题的求解提供可行方案。 　　关键词:并行计算;MPI;MPICH;集群 　　中图分类号:TP393.02 文献标识码:A 　　 　　Configure Parallel Computing Cluster by MPICH2 Based on RHEL5 　　LI Jian,LUO Yuan-cheng 　　(computer department,Chongqing Vocational Institute of Engineering,ChongQing 400037) 　　Key words: parallel computing;MPI;MPICH;cluster 　　 　　随着工作站和PC机性能的提高和网络技术的发展,集群系统(Cluster)是近年来人们开始研究的一种新计算机系统,也称网络并行计算系统,是利用高速通讯网络将一组高性能工作站或PC机连接起来而形成的一种分布式并行计算系统。它通常采用消息传递(Message Passing)的方式进行并行计算。消息传递接口(MPI - Message Passing Interface) 作为并行编程模型的代表和事实上的标准, 已经在越来越多的集群高性能计算中得到了使用。 　　MPI消息传递过程分为三个阶段:⑴消息装配,将发送数据从发送缓冲区中取出,加上消息信封等形成一个完整的消息;⑵消息传递,将装配好的消息从发送端传递到接收端;⑶消息拆卸,从接收到的消息中取出数据送入接收缓冲区。如图所示,整个传递过程可划分为三个层次:MPI层、内核层和网络接口层。MPI层处于整个传输的顶部,为用户提供一个透明通用的函数库,来完成用户程序的通信操作。内核层起到一个承上启下的作用,向上为MPI层提供socket接口函数,向下为网络接口程序准备skb数据空间。网络接口层与网络设备直接相连,处于传输的最底层,向上为内核层提供抽象的网络设备结构,屏蔽不同网络设备的区别,实现网络设备的统一管理。 　　 　　MPI是为开发基于消息传递模型的并行程序而制定的工业标准,其目的是为了提高并行程序的可移植性和易用性。参与MPI标准制定的人员来自欧美40多个组织,大部分主要的并行计算机制造商、大学研究所、政府实验室、工业组织等都投入到MPI标准化工作。有了统一的并行编程语言标准,并行计算环境下的应用软件及软件工具就都能够实现透明的移植,各个厂商就可以依据标准提供独具特色和优势的软件实现和软件支持,从而提高了并行处理的能力。 　　MPI只是一个并行编程语言标准,要编写基于MPI的并行程序,还必须借助某一MPI具体实现。MPICH是Linux平台下最重要的一种MPI实现,是一个与MPI规范同步发展的版本。LAM(Local Area Multicomputer)是Linux平台下另一免费的MPI实现。它由Ohio州立大学开发,主要用于异构的网格计算并行系统。 　　MPICH是可以免费从/mpi/mpich 取得,更为重要的是,MPICH是一个与MPI-1规范同步发展的版本,每当MPI推出新的版本,就会有相应的MPICH的实现版本。MPICH2是MPI(Message-Passing Interface)的一个应用实现,支持最新的MPI-2接口标准,是用于并行运算的工具,与之前版本相比MPICH2具备更加严谨和合理的结构,可移植性和效率更好,在程序设计语言上支持C/C++和Fortran。MPICH2的主页是/mpi/mpich2/index.htm,在这个页面上就能找到各平台最新版本MPICH2的下载地址,其中还包括源代码。最新源代码链接的地址是/pub/mpi/mpich2-1.0.8.tar.gz。在/pub/mpi下还有MPICH2的安装和使用指南文档,主要有三个,分别是Users Guide,Installers Guide和Windows Developers Guide。 　　 　　1 准备工作: 　　 　　1.1设置IP,更改主机名为station1,station3,station6,station8 　　 　　以四台pc为例,为了方便,分别更改了四台机器的主机名为station1,station3,station6,station8,以第一台为例: 　　hostname station1 　　这只是临