红原鸡全基因组中微卫星分布规律研究-四川动物.PDF

四川动物 年 第 卷 第 期 红原鸡全基因组中微卫星分布规律研究 黄杰 杜联明 李玉芝 李午佼 张修月 岳碧松 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院成都 摘要本文对红原鸡全基因组中微卫星数量及分布规律进行了分析查找到 个碱基重复类型 的微卫星序列共 个约占全基因组序列 的 分布频率为 微卫星序列的长度主要 在 个碱基长度范围内 第 条染色体上微卫星分布频率较高而 号染色体上无微卫星分布 不同 类型微卫星中单碱基重复类型数目最多为 个占总数的 其次是四二三五六碱基重复单元序 列分别占到总数的 是红原鸡基因组中最主要的微卫星重复类型 本研究为红原鸡微卫星标记的分离筛选遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础 关键词 红原鸡 基因组 微卫星 中图分类号 文献标识码 文章编号 微卫星序列 又称为短串联重复 得到广泛应用 序列 或简单序列重复 红原鸡 隶属鸡形目原 由 个核苷酸 鸡属是家鸡的祖先不同品种的家鸡均是由 的串联重复片段构成具有多态信息含量高分布广 红原鸡驯化培育而来的郑作新 杨宁李显 泛共显性遗传易于检测等优势在动物的个体识 耀 红原鸡在中国及中南半岛诸国均有分 别包括亲子鉴定 高焕孔杰 布国内主要分布于云南广西广东及海南已被列 种群遗传结构分析 为国家 类重点保护野生动物具有重大研究意义 基因定位基因连锁分析系统 傅衍等 包文斌等 发育 筛选了部分红原鸡微卫星多态性的位点但 遗传疾病研究 等方面 迄今为止红原鸡基因组微卫星丰度和分布状况未 收稿日期 接受日期 基金项目国家自然科学基金 作者简介黄杰 女硕士研究生从事保护生物学研究 同等贡献第一作者 通讯作者 四川动物 年 第 卷 第 期 见报道 本研究采用生物信息学的方法通过编制 不同类型微卫星分布频率分析 的计算机软件搜索红原鸡全基因组中的微卫星序 对微卫星各个重复类型进行统计分析表明表 列分析微卫星的丰度及其分布规律为进一步筛选 以单碱基重复的微卫星丰富度最高 多 微卫星位点群体遗传多样性及亲缘关系的研究提 达 个占微卫星总数的 其次是四碱 供数据基础 基重复的微卫星 为 个占微卫 星总数的 二碱基重复类型 为 研究方法 个占微卫星总数的 三碱基重复类型 红原鸡基因组序列