药材与资源鬼针草及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究.PDFVIP

·828 · 中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 45 卷 第 6 期 2014 年 3 月 • 药材与资源 • 鬼针草及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究 * 夏 至，高致明 ，李贺敏，张红瑞 河南农业大学农学院 中药材工程技术研究中心，河南 郑州 450002 摘 要：目的 构建鬼针草 Bidens pilosa 及其与近缘种之间系统发育关系，准确鉴别鬼针草及其近缘种。方法 提取鬼针草 及其近缘种 DNA ，对核基因 ITS 片段和叶绿体基因 psbA -trnH 序列扩增和测序，计算物种种内、种间 Kimura 2-parameter （K2P ）遗传距离。采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining （NJ ）系统聚类树3 种方法进行鉴定分析。结果 ITS 和psbA -trnH 分子系统树支持鬼针草不同居群样本聚为一单系分支，支持率为 79%和 87%；其中，鬼针草与白花鬼针草构成 一单系分支，金盏银盘与婆婆针构成姐妹群分支，上述两分支 ITS 和联合数据支持率均为 100%；狼把草与柳叶鬼针草、大 狼把草构成一单系分支（ITS 和联合数据支持率为 100%，psbA -trnH 数据支持率为 96% ）。鬼针草及其近缘种种间 ITS 和 psbA -trnH 序列的遗传距离为 0.007 94～0.128 80 和 0.005 18～0.074 52 ，均远大于鬼针草种内遗传距离 0～0.001 59 和 0～ 0.002 52 。结论 鬼针草与白花鬼针草亲缘关系最近，金盏银盘与婆婆针构成姐妹群关系，狼把草与柳叶鬼针草、大狼把草 亲缘关系较近。ITS 和psbA -trnH 序列可以准确鉴别鬼针草及其近缘种。 关键词：ITS ；psbA -trnH；鬼针草；分子鉴定；亲缘关系 中图分类号：R282.12 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2014)06 - 0828 - 07 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.06.017 Molecular authentication and phylogenetic relationship of Bidens pilosa and its relative species XIA Zhi, GAO Zhi-ming, LI He-min, ZHANG Hong-rui Research Center of Engineering Technology for Traditional Chinese Medicine Materials, College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China Abstract: Objective To construct the phylogenetic relationship of Bidens pilosa and its relative species, and to accurately identify B . pilosa and its relative species. Methods Total genomic DNA was isolated from B . pilosa and its relative species. Nuclear DNA internal transcibed spacer (ITS) and chloroplast gene psbA -trnH sequences were amplified and sequenced. The Kimura 2-parameter (K2P) distances were calculated. Authentication analyses were performed using Nearest Distance, BLAST1, and Neighb