Lammps_安装步骤详解-for Dai.docVIP

一 lamps非并行安装 1 在终端输入： cd /mnt （不一定要mnt啦） （源码包lammps.tar.gz放在/mnt下 (cp /home/lab/Desktop/lammps.tar.gz /mnt)） gunzip lamps.tar.gz tar -xvf lamps.tar mv lammps-5Dec10 lmp (重命名为lmp，重命名也不一定要是lmp啦) cd lmp/src/STUBS make clean make cd /mnt/lmp/src/MAKE vi Makefile.serial 后出现 # g++ = RedHat Linux box, g++4, gfortran, no MPI,no FFTSHELL = /bin/sh# ---------------------------------------------------------------------# compiler/linker settings# specify flags and libraries needed for your compilerCC =??? ??? g++4 g++4该为g++CCFLAGS =??? -g -ODEPFLAGS =??? -MLINK =??? ??? g++4 g++4改为g++LINKFLAGS =??? -g -OLIB =?????????? ARCHIVE =??? arARFLAGS =??? -rcSIZE =??? ??? size# ---------------------------------------------------------------------然后存档，退出，终端输入 cd /mnt/lmp/src make clean-all make serial 之后linux开始编译，最后会在/mnt/lmp/src下生成lmp_serial的可执行文件。 mv lmp_serial lmp 2 计算一example 终端输入： cd /mnt/lmp/e*/shear cp /mnt/lmp/src/lmp /mnt/lmp/e*/shear ./lmpin.shear 即开始计算 二lammps的并行安装（自己用户名下zhangchao建立文件夹mnt 和opt, 将下载的三个压缩包文件fftw-2.1.5.tar.gz、lamps.tar.gz、mpich2-1.3.1.tar.gz放在mnt文件夹中；在opt中建立文件夹fftw和mpich） 1 安装fftw 终端输入: cd /mnt gunzip fftw-2.1.5.tar.gz (源码包fftw-2.1.5.tar.gz在 /mnt下) tar xvf fftw-2.1.5.tar cd fftw-2.1.5 （find . -type f | xargs -n 5 touch）此步表示系统时间不对时采取的，一般不要。） ./configure --prefix=/public/home/zhangchao/opt/fftw --enable –float红字不要,prefix=指定安装在fftw中，要写出绝对路径，绝对路径获得方法：先cd opt/fftw,然后pwd,就获得绝对路径，经过鼠标copy(不能Ctrl C)就可获得，最后进入cd/mnt/fftw-2.1.5, 输入./configure --prefix=再右击鼠标paste即可 make make install (fftw-2.1.5即安装在/opt/fftw下) 2 安装mpich 终端输入: cd /mnt gunzip mpich2-1.3.1.tar.gz tar xvf mpich2-1.3.1.tar cd /mpich2-1.3.1 ./configure --prefix=/… …opt/mpich 方法同fftw make make install (mpich即安装在/opt/mpich下) 然后配置环境变量 终端输入: cd vi .bashrc 本人没有.bashrc利用了.bash_profile,因此编辑 vi .bash_profile, .bashrc和.bash_profile都是隐藏文件在自己的用户名zhangchao下,需要ls –al，才可以看到。 开始编译为 If [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi export PATH=/public/home/zhangchao/opt/mpich/bin:$PATH