中国蒙古马mtDNA DLoop高变区序列分析研究.pdfVIP

厘刍动翅盆壬遗佳撞苤塑左溘【-271 D-Loop高变区序歹q分析 中国蒙古马mtDNA 甚来李金莲石有斐 (内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特，010018) 摘要本文对5匹中国蒙古马mtDNAD—Loop高变区400bp核苷酸序列的变异情况进行分析。 结果发现5匹中国蒙古马mtDNA D·Loop高变区的平均核苷酸变异率为3．65％，其核苷酸变异类型包 括转换、颠挟和缺失3种形式，其中以转换最为常见。核苷酸变异位点较多，且个体之间差异大，说明这 5匹中国蒙古马的mtDNA D-Loop高变区多态性丰富。 关键词中国蒙古马；mtDNAD—Loop高变区；多态性 线粒体DNA(mitochondrial 显微镜观察到的，从此人们对线粒体中存在的遗传物质才有了初步的认识。随着科研工作的不断深入， 自20世纪80年代以来，mtDNA分析在动物进化遗传学、分子生态学、种群遗传结构分析、遗传多样性、 物种及品系鉴定等方面都得到了广泛的应用”o。mtDNA与核DNA相比，具有分子量小、结构简单、进 化速度快、母性遗传、无组织特异性及提取方便等特点。现在mtDNA作为一种遗传标记，在各种家畜上 研究的较多，发现一些了畜种mtDNA的多态性，并且已用于种间及品种间起源进化关系的分析”1。特 报道¨’5’61]，但关于马的mtDNAD-k叩高变区分析的有关报道甚少，特别对于蒙古马，在国内外还尚处 空白。本文拟对中国蒙古马的mtDNA D一‰p高变区序列核苷酸的遗传变异情况进行初步分析。 1材料与方法 1．1实验材料 实验动物：5匹蒙古马血样采自内蒙古自治区锡盟东乌旗牧民马场，用ACD抗凝，一70qC保存。 1．2总DNA的提取 总DNA提取参考Chen等”o方法。 1．3 PCR扩增和扩增产物的纯化 蒙古马mtDNA 行的。 正链引物为5-AGTCTCACCATCAACACCCAAAGC-3’； 负链引物为5-Ccl’GAAGTAGGAAccAcAl℃一3’。 本实验所采用的ExTaq ardPCR DNAPurification Preps System进行纯化。 1．4 mtDNA的测序 PRISM 纯化后的PCR产物寄往上海联合基因测序公司ABI 377—96测序仪进行测序。 2结果与分析 2．1核苷酸变异类型和位王 马的mtDNA全长为16 272 II虫国麴翅遗馕直弛硒塞进曼 马mtDNA D-Loop高变区核苷酸序列测序结果如图1所示。5匹蒙古马的D—Loop高变区的长度除4 号蒙古马为399bp外，其它的均为400bp。 圈1 4号t古马mtDNA D-Loop高变区序列分析 注：两端荻色部分为扩增引物。 为4，00％。 变异率为3．26％。 经分析，5匹中国蒙古马mtDNA D—Loop高变区的平均核苷酸变异率为3．65％。 2．2核苷酸变异率 5匹中国蒙古马mtDNA D-Loop高变区400bp的核苷酸变异率见表1。从表1可以看出，中国蒙古马 mtDNA D-Loop高变区序列的核苷酸变异类型包括转换、颠换和缺失3种形式，其中以转换最为常见。 衰1 5匹中圈蒙古马mtDNA D-Loop高变区的桉苷酸变异牢 样品 转换(％) 颤换(％)缺失(％) 合计(％) 1号马 3．50 050 n00 400