A Comprehensive Bioinformatics Analysis of the Lipoxygenases Superfamily in Shewanella Woodyi Strain （Strain ATCC 519081MS32）.pdfVIP

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2017-12-29 发布于广东
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A Comprehensive Bioinformatics Analysis of the Lipoxygenases Superfamily in Shewanella Woodyi Strain （Strain ATCC 519081MS32）.pdf

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JournalofMaterialsScienceandEngineeringB4(2)(2014)34-41 国 LI墨 HIN6 A ComprehensiveBioinformaticsAnalysisofthe LipoxygenaSeSSuperfamilyinShewanellaWoodyi Strain(StrainATCC519081MS32) SilvanaPomp6iaVal—MoraesandElianaGertrudesdeM acedoLemos Univers砂 ofEstadualPaulistaUNESP／FCA DepartmentTechnology,LBMP,ViadeAcessoProf．PauloDonatoCastellane，s／n． Jaboticaba1．saoPauloBrazil Received：January05，2014 ／Accepted：Jnauary31，2014／Published：February25，2014 Abstract：Sbewna ellabacteriahaverealpotentialforthebioremediationofcontaminatedenvironmentalandpresentsadifferential thatarethreelipoxygenasesdescribedinitsgenome．Lipoxygenases(LOX)areafamilyofiron-containingenzymesthatcatalyzethe dioxygenationofpolyunsaturatedfattyacidsinlipids．Theyoccurubiquitouslyinplantsandmammals，na donlyrecently，theyhave beendetectedincoral，moss，fungiandanumberofbacteriaaswel1．Inthiswork，analyzedthreeenzymeslipoxigenasesdescribed forShewanellawooay depositedinGeneBankasprobableLOX geneintheSwoo 2318 woodyfATCC 51908：ProteinsCode 一 (ACA86597．1)hypotheticalprotein，(ACA87192．1)arachidonatel5-lipoxygenasenad(AEF01209．1)arachidonate15-lipoxygenase precursorthestrain woodyiDSM 12036．Thebioinofrmaticstoolstendtosolveimpossibleproblemstobeaddressedinthepast decades．Theseanalysesidentifiedwerethethreeproteinsdescribed as1ipoxygenaseshavedifferentsecondary structures．the phosphorylationsites；theproteinGRAVY (grandaverageofhydropathy)andproteinisoelectricpointaredistinct．However，binding siteisFeofrthreelipoxygenases．Thissuggestedthatthreelipoxygenasesdeservespecialattentionofrworkinsitu，duetopeculiar characteristicsnadstillnotknow whatistheneedofS．woodyfhaveinitsgenomethreegenesencodingthesameprotein． Keywords：Arachidonate，crystallography，hypotheticalprotein 1．Introduction