迎接21世纪生命科学的新时代_基因组与蛋白组计划时代.doc

迎接 21 世纪生命科学的新时代 ———基因组与蛋白组计划时代 湖南医科大学分子生物学研究中心研究生 (长沙 410078) 谭文斌 朱定尔 专业导师 当全世界人类基因组计划在近年取得迅速和突出的进展 ,即将来临的 21 世纪将带领人类基因组计 划进入一个后基因组时代 、蛋白组计划 、生物信息学的新时代 ,所有这些将构成 21 世纪生命科学研究的 核心前沿和主流 。同样 ,生物信息学的成果将高度地拓展生命科学新的研究领域和加速其研究的进程 。 多种多样数以千万计的生命模式 (如生物大分子结构功能的模式) 的数字化 ,将是加快生命科学信息化 步入一个崭新的水平和时代的必由之路 。 关键词 :人类基因组计划 后基因组时代 蛋白组计划 生物信息学 21 世 纪 是 生 命 科 学 、信 息 科 学 的 世 纪 ,也必将是生命科学与信息科学融合交 汇发展的世纪 。以系统论的眼光来看 , 21 世纪的生命科学将由人???基因组计划和后 基因组时代 、蛋白组计划 、生物信息学 、生 命科学模式数字化等部分组成 。本文将就 21 世纪生命科学在这几方面的发展趋势 作一简要描述 。 一 、人类基因组计划和后基因组时代 人类基因组是指合成有功能的人体各 类细胞中蛋白质及/ 或多肽链和 RNA 所必 需的全部 DNA 顺序和结构 。也即包含人 类的 24 条染色体 ( 22 条常染色体和 X 、Y 两条性染色体) 上全部 DNA 所携带的遗传 信息的总和 ,其总长度约为 3 ×109 bp ,估约 含 8～10 万个基因 。人类基因组计划 ( Hu2 man Geno me Project , H GP) 旨 在 阐 明 人 类 基因组的全部序列 ,从整体上破译人类遗 传信息 ,使人类第一次在分子水平上全面 地认识自我 。主要包括四项任务 : ( 1) 遗传 图谱的建立 ; (2) 物理图谱的建立 ; (3) DNA 顺序测定 ; ( 4) 基因的 识 别 。美 国 于 1990 年正式启动 H GP , 15 年时间内提供 30 亿 美元的资助 。现预计整个基因组测序工作 将于 2005 年之前完成 。1 当基因数据库逐渐地被填充时 , 下一 步便是 要 研 究 这 些 基 因 到 底 有 怎 样 的 功 能 , 这 就 是 后 基 因 组 时 代 ( Po st geno me Era) 2 的到来 。8～10 万个基因的功能研 究比 H GP 更为复杂和艰巨 ,必将成为下个 世纪生命科学研究的主战场 。其主要任务 有 :11 研究组织器官特异 性 的 基 因 表 达 : 迄今发展起来的基因表达系列分析法 ( Se2 rial Analysis of Gene Exp ressio n , SA GE) 和 微排列分析法 ( Microarray assay) 可同时对 上千种基因的表达进行研究 。预计这两种 方法将 成 为 今 后 研 究 基 因 表 达 的 主 要 手 段 。2 ,3 21 基因表达与调控研究 。基因表 达除组织特异性外 ,还有发育阶段特异性 等方面精确调控 。近来的研究表明 , 基因 的表达调控不能简单地认为是几个反式作 用因子 和 顺 式 作 用 元 件 间 有 序 地 相 互 作 方法 ,创立新的方法 , 在现有研究基础上 , 从而认识生命的本质 ———遗传信息的传递 利用数学 、统计学 、信息学的研究成就 , 对 基因表达调控的可能模式在理论上进行预 测 。31 基因组 95 %左右的“废弃”DNA 信 息的运作规律尚未有突破性认识 , 这些非 编码区 DNA 是否为调控序列或为有其它 作用的序列 ? 又是如何发挥其功能的 ? 这 些问题与基因的表达调控有部分的重叠 , 期待着科学家去研究 。41 基因诊断 、基因 治疗和基因工程产品开发将展现出广阔的 应用前景 ,将引发临床诊断和治疗以及医 药工业的变革 。 人类基因组计划和后基因组时代研究 任务是异常复杂和艰巨的 ,以人类基因组 计划为例 ,如果每个实验室克隆一个新的 基因 ,欲完成人类整个基因组的克隆则需 8～ 10 万个实验室 ; 再加上各个实验室间 条件 、人员素质不一以及实验室之间的重 复竞争等不利因素对完成克隆整个人类基 因组显然不知要到何年何月 。然而 , 我们 若将人类 8 ～ 10 万个基因视为一个整体 , 从整体水平上去考察基因的存在 、基因的 结构与功能 、基因之间的相互关系 ,即用系 统论的方法进行研究 ,对整个计划系统的 组织实施 ,也可能迎刃而解 。因此 ,人类基 因组计划的实施是系统论方法在生命科学 中的典型运用 。同时也说明了当代科学研 究模式从以往的自由 、盲目 、独立 、小规模 走向社 会 化 、整 体