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第三章 酶和维生素 2009-2-25
第3章 酶和维生素;酶的概念;第一节酶的分子结构与功能The Molecular Structure and Function of Enzyme;酶的不同形式:;一、酶的分子结构与功能;全酶分子中各部分在催化反应中的作用:; 辅酶 (coenzyme):
与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。 ;转移的基团;金属酶(metalloenzyme)
金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。
金属激活酶(metal-activated enzyme)
金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。 ;金属离子的作用:
参与催化反应,传递电子;
在酶与底物间起桥梁作用;
稳定酶的构象;
中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。;与酶催化反应关系密切的氨基酸侧链基团---必需基团;指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。;;活性中心内的必需基团;底 物 ;酶活性测定和酶活性单位;国际单位(IU)
在特定的条件下,每分钟催化1μmol底物转化为产物所需的酶量为一个国际单位。 ; 国际酶学委员会(Enzyme Commission, EC)将所有的酶按它们所催化的反应的性质分为六大类。;分类序号;其书写方式是:;乙醇脱氢酶的编码是: EC1.1.1.1
第一个“1”—— 第1大类,即氧化还原酶类;
第二个“1”—— 第1亚类,供氢体为CHOH;
第三个“1”—— 第1亚亚类,受氢体为NAD+;
第四个“1”—— 在亚亚类中的顺序号。;二、酶的命名
(一)习惯命名法
根据底物命名; 2. 根据反应类型命名
根据底物+反应类型命名
(二)系统命名(国际酶学委员会规定,IEC)
系统名称 + 酶的分类与编号 + 习惯名称
(所有底物+反应性质) 1 ? 6 大类 底物 + 反应类型
1、2---亚类 / 大类
1、2--亚亚类 / 亚类
酶的特定编号 / 亚亚类; 酶的国际习惯用名和系统命名的应用实例;酶的分类;国际酶学委员会建议:
每个酶都给予 2 个名称;酶与一般催化剂的相同点:;酶的高效催化能力;;酶的高度特异性;绝对特异性;(三)酶活性对环境因素有很高的敏感性
(四)可调节性 抑制剂和激动剂
共价修饰改变酶的结构
表达量影响总体活性
;酶催化作用的本质:降低反应活化能
酶催化作用的中间产(络合)物学说
在酶催化的反应中,第一步是酶与底物形成酶-底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化后,中间复合物再分解成产物和酶。
E + S ==== E-S ??? P + E
许多实验事实证明了E-S复合物的存在。E-S复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。
;锁钥假说:认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样。;酶;(二)共价催化:亲核、亲电
催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡中间产物,使反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为共价催化
酶中参与共价催化的基团主要包括 His 的咪唑基,Cys 的硫基,Asp 的羧基,Ser 的羟基等。
某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。
;(三)酸碱催化:
专一的酸碱催化
总酸碱催化 质子供体或质子受体参与的催化
His 残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。
;(四)金属离子催化
作为酶活性中心的催化基团直接参与传递电子等催化反应
与酶蛋白结合后,稳定酶发挥催化作用的活性构象
结合在酶蛋白上,中和酶与底物结合的局部环境的负电荷,降低静电排斥而促进对底物的结合
作为辅助因子连接酶与底物,便于酶对底物的识别;(五)临近效应与表面效应
(1)临近定向效应:
在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心,一方面底
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