随机基因松弛振子的同步和聚类研究.pdfVIP

随机基因松弛振子的同步和聚类 周天寿* 中山大学数学与计算科学学院，广州510275 摘要 本文研究了具有相抑制耦合细胞通信的随机基因松弛振子的动力学. 我们显示出振子之间的相差分 布是否能展示单峰、双峰或多峰分布依赖于噪声强度和细胞密度，而且发现存在细胞数目的一个阈值，当 细胞数目超过此阈值时，对于任意的噪声强度相差分布函数的峰值性几乎保持不变. 关键词 基因调控网，随机振子，同步，聚类 Synchronization and Clustering of Stochastic Genetic Relaxation Oscillators Tianshou Zhou School of Mathematics and Computational Science, Guangzhou 510275, P.R. China Abstarct ：An ensemble of stochastic genetic relaxation oscillators via phase-repulsive cell-to-cell communication are investigated. It is found that the distribution of phase differences among the stochastic oscillators can display such characteristic as unimodality, bimodality or polymodality, depending on both noise intensity and cell number, but the modality of phase difference distribution almost keeps invariant for an arbitrary noise intensity as the cell number is beyond a threshold. Key words Gene regulatory network, stochastic oscillator, synchronization, clustering 1. 引言 生命是有节律的[1-9]，生物组织或系统 本文中，我们将从一个侧面来剖析一类典型 正是依靠节律行为来有效地传输信息，保持 生物振动系统中噪声的效果，重点在于揭示 它们有条不紊地工作. 但问题是如何来保 噪声诱导随机现象的生物物理机制. 我们 证这种节律行为呢？生物实验学试图从实 将研究一类特别的基因振子，即随机基因松 实验的角度来找出产生节律行为的关键调 弛振子，试图找出这类振子在相抑制的细胞 控因子，及弄清影响细胞群体产生群体协作 通信情况下取得同步和聚类的机制。我们将 行为的信号转导路径（即信号转导通路）； 呈现某些有趣的现象，这些现象本身是属于 另一方面，理论工作者试图从理论的角度来 噪声诱导动力学的范畴，但进一步丰富了随 建立有关数学模型，用以刻画各种节律产生 机动力学的内涵. 子和各种多细胞振动系统，并试图揭示产生 2 ．模型和定义 有关节律现象的理论机制. 首先，我们给出我们自己设计和构造的 众所周知，噪声对生物系统的动力行为 基因调控网，如图 1所示，这里我们假定三 有重要影响. 已有生物实验和理论工作表 个基因在相同的启动子的作用下，分别产生 明随机波动会破坏生物系统的稳定性，但也