第二章-核酸.ppt

5’ 5’ 3’ 3’ DNA一级结构：核苷酸的排列顺序。每个核苷酸戊糖上的3′-OH和相邻核苷酸戊糖上的5′-磷酸形成3′，5 ′ ---磷酸二酯键相连成长链 结构式 5′-磷酸端（常用5′-P表示）；3′-羟基端（常用3 ′-OH表示） 核苷酸链具有方向性，当表示一个核苷酸链时，必须注明它的方向，一般是5′→3′。 DNA一级结构的概念、特点与功能： 概念：脱氧核苷酸（碱基）在分子中的排列顺序 DNA分子一级结构特点 A:DNA是没有分支的多核苷酸长链，各脱氧核苷酸之间以3′5′—磷酸二酯键相连 B：相间排列的戊糖和磷酸构成脱氧核糖核酸大分子的主链，而其碱基则可看成是侧链基团； H H H 5′ 3′ OH C:天然DNA分子长链的两端，总是有一个核糖带有自由的5′-磷酸，而另一端的核糖带有自由的3′-OH。DNA的方向就是从5′端到3′端； D:DNA分子的核糖的2′位上没有自由羟基,这DNA作为主要遗传物质极其稳定的根本原因，特别是对于碱的抵抗力。 DNA分子一级结构的意义: 不仅在于它的碱基排列可通过转录以密码子的方式蕴藏了遗传信息,而且还决定了DNA的二级结构和空间结构。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。 Watson 和 Crick 于1953年提出了DNA双螺旋结构模型，说明了DNA 的二级结构。（即B型DNA） 双螺旋结构的结构特点 （1）主链：脱氧核糖和磷酸基通过3′5′—磷酸二酯键连接成为螺旋的主链骨架，二条主链以反平行方式组成右手螺旋；主链处于螺旋外侧，这是由核糖和磷酸的亲水性所决定的；核糖平面与螺旋轴平行，碱基处于螺旋的内侧 (2)直径与螺距:螺旋的直径为2nm；螺距（双螺旋链中的任意一条链绕轴一周所升降的距离）为3.4nm,其中包含10个核苷酸,因此同一条链上相邻碱基之间的轴向距离(碱基堆积距离)0.34nm,相对于螺旋轴移动36°. 2.0 nm （3）碱基对：由于双螺旋结构要求有一个正常的螺旋形式，就必须按碱基互补的原则进行碱基配对；嘌呤环和嘧啶环上的氨基和酮基是亲水的，两条链配对的碱基之间能够形成氢键；而嘌呤环和嘧啶环本身都是疏水的，因而同一条链中的相邻碱基能够形成一种堆积力；这两种力的协同作用就维持了双螺旋结构的稳定性 (4)大沟小沟:两条主链和碱基并不充满双螺旋的空间,其表面形成两条凹槽,一条宽而深为大沟；一条狭而浅为小沟。特别是大沟,对于Pr识别DNA双螺旋结构上的特定信息是非常重要的。因为只有在沟内，Pr才能“感觉”到不同碱基顺序，而在双螺旋的表面全是相同的磷酸和脱氧核糖的骨架，是没有什么信息可言的 2.0 nm 小沟 大沟 DNA的三级结构——超螺旋 1）超螺旋是指双螺旋进一步扭曲或再螺旋的构象。 2）正超螺旋（变紧，过旋）和负超螺旋（变松，欠旋）。 3）人类46条染色体的 DNA总长可达1.7-2.0m，经过螺旋化压缩，实际总长只有200nm。 真核生物的基因一般分布在若干条染色体上 DNA与组蛋白结合成染色体 组蛋白是真核生物染色体的基本结构蛋白，富含带正电荷的Arg和Lys等碱性氨基酸，pI一般在10.0以上，属碱性蛋白质，可以和酸性的DNA紧密结合，而且一般不要求特殊的核苷酸序列 核小体——染色体的基本结构单位 DNA压缩的基本原则是在螺旋上形成螺旋，再形成螺旋 组蛋白与DNA的结合 真核生物染色体DNA组装的不同层次的结构 DNA 核小体链 纤丝 突环 玫瑰花结 螺旋圈 染色体 2.3 RNA的结构与功能 2.3.1 RNA的分子组成和种类 2.3.2 RNA的分子结构 ㈠、 RNA的一级结构 ㈡、 RNA的二级结构 ㈢、 RNA的三级结构 ㈣、 mRNA ㈤、 tRNA ㈥、 rRNA ㈦、 反义RNA 2.3 RNA的结构与功能 RNA的基本组成单位是核苷酸 主要有AMP、GMP、CMP、UMP 主要种类有mRNA、tRNA、rRNA RNA的一级结构: RNA分子中各核苷酸（碱基）的排列顺序叫做RNA的一级结构 OH OH OH 5′ 3′ RNA与DNA的差异 DNA RNA 糖 脱氧核糖 核糖 碱基 AGCT AGCU 不含稀有碱基 含稀有碱基 tRNA二级结构特征 单链 三叶草叶形 四臂四环 酵母tRNA Ala 的二级结构 DHU/D环 I G C 反密码子 反密码环 氨基酸臂 可变环 TψC环 C C A Ala 3′ 5′ D臂