合成生物学研究进展和其风险.PDFVIP

合成生物学研究进展及其风险 关正君 魏伟 徐靖 1 合成生物学研究概况 合成生物学(synthetic biology)是在现代生物学和系统科学基础上发展起来的、融入工程 学思想的多学科交叉研究领域。其包括了与人类自身和社会发展相关的研究方向和内容，为 解答生命科学难题和人类可持续发展所面临的重大挑战提供了新的思路、策略和手段。2004 年，合成生物学被美国麻省理工学院出版的Technology Review 评为“将改变世界的十大新 技术之一”。2010 年12 月，Nature 杂志盘点出2010 年12 件重大科学事件，Science 杂志评 出的科学十大突破，合成生物学分别排名第4 位和第2 位。为此，世界各国纷纷制定合成生 物学发展战略及规划，开展合成生物学研究，以抢占合成生物学研究和发展先机，促进了合 成生物学基础研究和应用研究的快速发展。同时合成生物学的巨大应用潜力，还吸引了众多 公司及企业参与到该领域的研究开发，推动着合成生物学产业化的进程。 合成生物学作为后基因组时代生命科学研究的新兴领域，其研究既是生命科学和生物技 术在分子生物学和基因工程水平上的自然延伸，又是在系统生物学和基因组综合工程技术层 次上的整合性发展。与传统生物学通过解剖生命体以研究其内在构造不同，合成生物学旨在 将工程学的思想用于生物学研究中，以设计自然界中原本不存在的生物或对现有生物进行改 造，使其能够处理信息、加工化合物、制造材料、生产能源、提供食物、处理污染等，从而 增进人类的健康，改善生存的环境，以应对人类社会发展所面临的严峻挑战。 作为一个新的基础科学研究领域，合成生物学综合生物化学、生物物理和生物信息技术 与知识，涵盖利用基因和基因组的基本要素及其组合，设计、改造、重建或制造生物分子、 生物体部、生物反应系统、代谢途径与过程，乃至整个生物活动的细胞和生物个体。合成生 物学使人们可以利用与物理学方法类似的模块构建和组装形成新的生命有机体，从而人工设 计新的高效生命系统。中科院《2013 年高技术发展报告》指出，DNA 测序技术、DNA 合 成技术和计算机建模是支撑合成生物学发展的关键技术。近年来，大量物种的全基因组测序， 为合成生物学家构建功能组件的底盘生物体系提供了丰富的遗传信息。快速、廉价的测序技 术也促进了新的系统和物种的识别和解析。 2 合成生物学应用研究进展 2.1 合成生物学在医药工业领域的应用 2.1.1 天然药物合成生物学 天然药物合成生物学是在基因组学研究的基础上，对天然药物生物合成相关元器件进行 发掘和表征，借助工程学原理对其进行设计和标准化，通过在底盘细胞中装配与集成，重建 生物合成途径和代谢网络，从而实现药用活性成分定向、高效的异源合成，以解决天然药物 研发和生产制造的一系列重大问题 (陈士林，2012) 。在天然药物设计合成领域，合成生物 学的应用使人们能够更为精确地控制代谢途径，利用对天然产物生物合成途径的遗传操作来 生产基于天然产物的创新药物分子，也可以设计和构建一些能够生产重要天然药物的人工合 成的“超级产生菌”，只需对“超级产生菌”进行发酵就可以直接获得所需的目的化合物， 有望成为未来最有前途的药物生产的绿色环保技术之一，可以有效解决植物来源的天然药物 研发可能引起的资源问题。目前合成生物学已在一些药用天然产物的制造中获得了较大的进 展。 2.1.1.1 抗疟疾药物青蒿素的合成生物学 青蒿素(Artemisinin)与其他药物的联合使用，是目前唯一一种较有效的治疗疟疾的方法。 天然的青蒿素是在草药青蒿中提取的有过氧基团的倍半萜内酯药物，但是其产量十分稀少， 提取工艺复杂，提取成本极其昂贵，也很难用化学方法合成，所以，供应量无法满足患者医 治的需要。经过十几年的发展，天然药物合成生物技术已被成功地应用到青蒿素的规模化制 备中，并取得了一系列成果。青蒿素的合成生物学研究是伴随其生物合成途径的逐步阐明而 发展起来的。由于从青蒿酸/二氢青蒿酸形成青蒿素的途径不是很清楚，现在通过合成生物 学技术制备青蒿素的研究绝大部分采用的都是一种半合成的路线。 即通过代谢工程制备青 蒿素的前体如紫穗槐-4, 11-二烯、青蒿酸和二氢青蒿酸，然后通过半合成的方法合成青蒿素。 经过若干年的发展，青蒿素合成生物学的研究取得了重要进展，呈现出如下特点。（1） 底盘细胞种类多样。迄今为止，用于青蒿素及其中间体合成生物学研究的底盘细胞有大肠杆 菌、酿酒酵母、植物细胞和其他微生物。（2