嗜热链球菌谷氨酸脱羧酶基因及其侧翼区序列分析-食品科学.pdfVIP

※生物工程 食品科学 2011, Vol. 32, No. 03 121 1 2 3 , 3 3 3 林 谦 ，杨胜远 ，陆兆新 * ，吕凤霞 ，别小妹 ，邹晓葵 (1.玉林师范学院化学生物系，广西 玉林 537000 ； 2.韩山师范学院生物系，广东 潮州 521041 ； 3.南京农业大学食品科技学院，江苏 南京 210095) 从嗜热链球菌Streptococcus thermophilus Y-2 的谷氨酸脱羧酶基因(gadB)及其两侧旁邻序列出发，在GenBank 中分别用Blastn 、Blastx 搜索同源序列。gadB 在核酸水平上无法找到同源序列，在蛋白质水平上与多种细菌的谷 氨酸脱羧酶同源。根据谷氨酸脱羧酶的氨基酸序列构建系统发育树，菌株Y-2 与具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 的亲缘关系最近。gadB 的上游侧翼区与嗜热链球菌LMG 18311 的插入序列IS1216 转座酶基因具有很高的相似性。gadB 的下游侧翼区在核酸水平上未找到同源序列，在蛋白质水平上与谷氨酸/ γ- 氨 基丁酸转运蛋白有很高的相似性。菌株 Y-2 的gadB 、gadC 排列方式与大肠杆菌、弗氏志贺菌的相同，而与乳酸 乳球菌、短小乳杆菌的相反。在已完成全基因组测序的 3 个模式株 Streptococcus thermophilus LMG 18311 、 CNRZ1066 、LMD-9 中均含有插入序列 IS1216 ，但未发现谷氨酸脱羧酶基因gadB 、谷氨酸/ γ- 氨基丁酸转运蛋白 基因 gadC 。 嗜热链球菌；谷氨酸脱羧酶；γ- 氨基丁酸；序列分析 Sequence Analysis of Glutamate Gecarboxylase Gene and Flanking Regions from Streptococcus thermophilus Y-2 .. 1 2 3, 3 3 3 LIN Qian ，YANG Sheng-yuan ，LU Zhao-xin *，LU Feng-xia ，BIE Xiao-mei ，ZOU Xiao-kui (1. Department of Chemistry and Biology, Yulin Normal University, Yulin 537000, China ； 2. Department of Biology, Hanshan Normal University, Chaozhou 521041, China ； 3. College of Food Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China) Abstract ：The glutamate decarboxylase gene (gadB) and its flanking regions from Streptococcus thermophilus Y-2 were i