氧化应激诱导的大鼠Müller细胞微小RNA表达谱的初步研究精选.pdfVIP

第 36卷第6期 同济大 学学 报 (医学 版 ) VOL36NO．6 2015年 l2月 JOURNALOFTONGJIUNIVERSITY(MEDICALSCIENCE) Dec．，2015 doi：10．16118／j．1008—0392．2015．06．001 ·基础研究 · 氧化应激诱导的大鼠Miiller细胞微小 RNA表达谱的初步研究 张介平 ，郑 莉 。，王 娟 ，吕立夏 。，徐 国彤 (1．同济大学医学院眼科研究所，上海 200092；2．同济大学医学院再生医学系，上海 200092； 3．同济大学医学院干细胞研究中心，上海 200092) 【摘要】目的 研究在氧化应激条件下视网膜MUller细胞的miRNA表达谱，为寻找氧化应激条件下Miiller细胞 的靶向分子提供线索。方法 用 2mmol乙二醛处理大 鼠Miiller细胞48h，然后收集细胞，抽提总RNA，本研究采 用小RNA两端加接 头序 列，反 转录，克 隆，随机测序的方法构建大 鼠Miiller细胞 系的小 RNA文库，序列经 GenebankBlastn和miRBase比对分析 ，Mfold软件在线预测二级结构验证miRNA，经qRT—PCR鉴定miRNA，通过 miRPath分析mtiller细胞表达的miRNA相关信号通路。结果 本文库获得 163个有效序列，31个克隆为已知 miRNA序列，代表 13种miRNA，它们与PI3K—AKT，MAPK，细胞外基质的合成及相互作用等多条信号通路密切相 关。发现 1个新miRNA序 列。结论 氧化应激条件 下表达的miRNA为更好地 了解在生理和疾病条件下的 MUller细胞功能提供有益的线索。 【关键词】氧化应激；微小RNA；Miiller细胞；大鼠 【中图分类号】R571 【文献标志码】A 【文章编号】1008—0392(2015)06—0001—07 ExpressionprofileofsmallRNA inratM iillercellsunderoxidativestress ZHANG Jie-ping ， ，ZHENG Li ，WANG Juan ’ ，LVLi．xia。’ XU Guo．tong ’ ， (1．TongiiEyeInstitute，MedicalCollege，TongjiUniversity，Shanghai200092，China； 2．Dept．ofRegenerativeMedicine，MedicalCollege，Ton~iUniversiyt，Shanghai200092，China； 3．Stem CellResearchCenter，MedicalCollege，Ton~iUniversity，Shanghai200092，China) 【Abstract】Objective ToinvestigatethemiRNAexpressionprofileofratMailercellsunderoxidative stress．M ethods RatMOilercellswere rteated wiht 2mM ofglyoxalfor48 h and totalRNA was exrtacted．ThesmallRNA librarywasgeneratedbyaddinglinkerstoboht endsofsmallRNA，reverse rtanscription，cloningandrandom sequencing．ThesequencesweresubjectedtoGenebankBlastnand miRBaseofrse