生化--绪论和蛋白质化学.ppt

3.2 二级结构 3.2.1 概念：指多肽链主链通过不同肽段自身 的相互作用而形成的折叠和盘绕方式。 类型：?-螺旋 ，?-折叠，?-转角，无规 则卷曲 酰胺平面：由于肽键具有部分双键性质， 因此不能自由旋转，氢原子和氧原 子分别位于肽键两侧，构成一个相 对刚性的平面，叫….. 3.2.2酰胺平面：  两面角：? 角， ?角 3.2.3 二级结构---- （1）?-螺旋 多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转，形成螺旋结构，螺旋一周，沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个氨基酸残基；两个氨基酸之间的距离为0.15nm; 肽链内形成氢键，氢键的取向几乎与轴平行，第一个氨基酸残基的酰胺基团的-CO基与第四个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。 蛋白质分子为右手?-螺旋。 ?-螺旋 ?-螺旋稳定性靠链内氢键维持 （2）?-折叠 ?-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿状折叠构象 在?-折叠中，?-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直，两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm； （2）?-折叠 ?-折叠结构的氢键主要是由两条肽链之间形成的；也可以在同一肽链的不同部分之间形成。几乎所有肽键都参与链内氢键的交联，氢键与链的长轴接近垂直。 ?-折叠有两种类型。一种为平行式，即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式，即相邻两条肽链的方向相反。 （3）?-转角?-turn 在?-转角部分，由四个氨基酸残基组成; 弯曲处的第一个氨基酸残基的 -C=O 和第四个残基的 –N-H 之间形成氢键，形成一个不很稳定的环状结构。 这类结构主要存在于球状蛋白分子中。 (4) 无规则卷曲/自由回转 指多肽链主链没有一定规则的松散结构 往往与蛋白质活性有关 生物化学—绪论 王声斌 Biochemistry 1. 生物化学概念 （Biochemistry/Biological chemistry) 生物化学是研究生物的化学组成和生命过程中化学变化的一门科学。 生物化学是介于生物学与化学之间的一门新兴的边缘学科。生物体也有基本的化学元素组成，因此，遵循化学物质结构与变化的原则和规律。 一、生物化学概念和研究内容 （1）生物体组成成分的性质、结构及结构与功能的关系 糖类、脂类、蛋白质、核酸 C, H, O, N, S Fe, Cu 2.研究内容 (2)研究生物体的新陈代谢（metabolism) 生物体最显著的特征就是能够进行新陈代谢 同化作用、 异化作用 糖、脂、蛋白质 酶----重要作用 （3）研究生物体的自我复制 核酸化学 分子生物学研究的基础 上述只是生化目前的研究内容，这与科技 发展水平相联系，随着研究的深入，更多 内容需解决 现代科学-----15世纪下半叶 现代生化-----18世纪下半叶 生物化学作为一门学科-----1877年 霍佩-赛勒 “Biochemie” 经过100年的发展，-------- 二、生化历史 学习方法 生物化学是一门枯燥的学科，新兴的学科 学习生化要有一定的化学基础，有机化学 理性知识，需要理解与记忆并重 做好笔记，课下复习，课前预习 第一章 蛋白质（Protein) 早在1878年，恩格斯指出：“生命是蛋白体的 存在方式。” 蛋白质：是一条或多条由氨基酸通过肽键共价 连接而成的多肽链构成的生物大分子。 C,H,O,N,S… 氨基酸 蛋白 质 多肽链 蛋白质的化学元素组成主要是C、H、O、N、 S，部分蛋白质还含有P和Fe、Cu、Mo、Zn、 I和Se等微量元素。蛋白质中氮元素的平均含 量为16%，这是凯氏定氮法测定蛋白质含量 的根据，蛋白质含量%=氮含量×6.25（100/16） 蛋白质分类 按其所含成分---- 简单蛋白质---全部为氨基酸 结合蛋白质---蛋白质