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练习五、胁迫缓解效应的分析
胁迫缓解效应的分析
1
范例
背景:A离子会导致植物发生胁迫应激,而B离子具有缓解A离子胁迫的作用。
实验处理组组合为:CK组、A处理组、(A+B)处理组。
结果(如左图):
问题:A组 和 AB处理组是否真的没有差异,分析是什么现象导致了这个结果。
CK vs A: 有大量差异基因;
CK vs (A+B):依然有大量差异基因;
A vs(A + B):没有差异;
分析思路
(1)维恩图:
使用温恩图比较两组差异基因。
(2)散点图
可以弥补以上的不足,展示特定基因细类在两种条件下的变异大小。
3
韦恩图结果
4
结果
模式推测
?
?
或 ?
CK vs AB
5
CK vs A
6
intersection
7
从散点图可以看出
A、AB变化方向相同(一、三象限);
B 离子对A的应激有缓解作用(基因普遍位于第一象限45°对角线以下);
加入B后(即AB组),对基因的干扰普遍不大(波动普遍小于1)
8
1
1
这也解释了A vs AB 差异少的原因
例如:
A / CK = 10
AB/CK=7
A/AB =1.4
应激区间
缓解区间
这也解释了AB -vs A差异基因极少
也许我们认为
10
谢 谢
11
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