逢甲大学资讯工程学系专题研究报告-研讨室借用.PDF

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逢 甲 大 學 資 訊 工 程 學 系 專題研究報告 蛋白質交互作用位置搜尋比對與 分析系統 指導教授:游景盛 學 生:黃凱斌資訊四乙 ( ) 陳志誠資訊四乙 ( ) 簡士翔 資訊四乙 ( ) 張瀚文 資訊四乙 ( ) 中 華 民 國 一 百 年 四 月 目錄 第一章、緒論 1 1.1 研究背景 1 1.2 研究動機 2 1.3 研究目的 3 1.4 研究流程 4 1.5 工作分配 6 第二章、 功能概述 7 2.1 交互作用 7 2.2 序列比對 8 第三章、開發平臺與軟體介紹 9 3.1 開發平臺介紹 9 3.1.1 「Windows OS 」 9 3.1.2 「Apache2.2 」 9 3.2 開發軟體介紹 11 3.2.1 「Dreamwaver CS 5 」11 3.2.2 「PHP5 」11 3.2.3 「MySQL 」 14 3.2.4 「phpMyAdmin 2.10.3 」 15 3.2.5 「ActivePerl 007 」 15 3.2.6 「DEV C++ 」 15 3.2.7 「Blast - 2.2.25+ 」 16 第四章、 生物資訊相關介紹 17 4.1 Protein Data Bank簡介 17 4.2 PDB File Format 18 4.3 胺基酸 Amino acid 26 4.4 BLAST簡介 29 第五章、 系統架構與實做 31 5.1 交互作用運算 31 5.2 前置處理 - PDB資料擷取 31 5.3 資料庫建置 38 5.3.1 資料庫所支援的功能: 38 5.3.2 資料庫的欄位 38 5.3.3 寫入資料庫 40 5.4 網頁架構 42

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