第04章_核酸之3-5.pptVIP

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第04章_核酸之3-5

第四章 核酸;一、DNA一级结构;(2)字母式书写 ???? ?① 5’ -pApCpGpTpAOH-3' ?? ??? ② 5’ -ACGTA-3';3、一级结构的测定(测序);;;同一生物的不同组织的DNA碱基组成相同; 同一种生物DNA碱基组成不随生物体的年龄、营养状态或者环境变化而改变; 几乎所有的DNA,无论种属来源如何,其腺嘌呤摩尔含量与胸腺嘧啶摩尔含量相同[A] = [T],鸟嘌呤摩尔含量与胞嘧啶摩尔含量相同[G] = [C],总的嘌呤摩尔含量与总的嘧啶摩尔含量相同[A]+[G]=[C]+[T]。 不同生物来源的DNA碱基组成不同,表现在A+T/G+C比值的不同。这些结果后来为DNA的双螺旋结构模型提供了一个有力的佐证。;;(二)?DNA的二级结构——双螺旋结构;两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕进行右手螺旋。 碱基位于双螺旋内侧,磷酸和戊糖相间排列组成骨架,位于外侧。 螺旋平均 d=2 nm,碱基堆积距离0.34 nm,相邻核苷酸之间夹角为36?,每旋转一周包含10碱基对(base pair,bp),每周高度3.4 nm。;两条链的碱基之间互补配对方式为:A→T, C→G。 双螺旋表面有大沟(major groove)和小沟(minor groove): 大沟:宽1.2 nm,深0.85 nm 小沟:宽0.6 nm,深0.75 nm ;碱基配对的结构;3.4 nm; DNA结构双螺旋结构的提出,被认为是本世纪生命科学史最重要的贡献之一,同时也是自然科学史上的重大贡献。它直接解释了生物遗传信息的传递与表达的规律,使生命科学从此进入一个崭新的时代即分子生物学时代。;2、DNA双螺旋结构的稳定因素;(三) DNA二级结构的多态性;;1. DNA双螺旋的不同构型;;;⒉ 与DNA碱基顺序相关的特殊二级结构;核酸分子中的回文序列;单链的回文序列可形成发卡结构;双链回文序列可形成十字架结构;(2) 镜象结构 ;  多嘌呤-多嘧啶的镜象序列可形成三螺旋结构(H-螺旋或 Hoogsteen 螺旋):该螺旋常处在许多真核细胞基因的表达调节区。可能与基因表达的调节有关。;3、三链与四链DNA;?三、?DNA的三级结构和真核细胞?DNA的组装;有些单链环形染色体(如φ×174)或双链线形染色体(如噬菌体λ ),在其生活周期的某一阶段,也必将其染色体变为超螺旋形式。 对于真核生物来说,虽然其染色体多为线形分子但其DNA均与蛋白质相结合,两个结合点之间的 DNA 形成一个突环(loop)结构,类似于CCC分子,同样具有超螺旋形式。; 超螺旋按其方向分为正超螺旋和负超螺旋两种。真核生物中,DNA与组蛋白八聚体形成核小体结构时,存在着负超螺旋。研究发现,所有的DNA超螺旋都是由DNA拓扑异构酶产生的。;;(二) 真核细胞染色体的组装 ; 两个核心颗粒之间由一段双螺旋DNA链(约60 bp)相连,称为连接部。组蛋白H1结合在此部位。;核小体结构 ;;;染色体组装的层次;第四章 核酸;????四、RNA的分子结构 ;二级结构:茎环,发夹结构;结构特点: 分子大小约为25 kD,4 S,70 - 90 bp。 5’ 端多为pG,3’端均为CCA-OH,用来接受活化的氨基酸。;3. 二级结构为四环四臂(也称为茎)的三叶草型结构;tRNA的?三级结构: 倒L形;(三) rRNA的分子结构 1、含量最丰富,约占总RNA的80%。 2、rRNA的种类与大小;3、rRNA的二级结构与三级结构没有固定的模式;4、rRNA的功能是构成核糖体,在蛋白质的合成中起着催化肽键形成的作用。;;(四) mRNA的分子结构特点;2、真核生物;编码区两端存在非编码区,即其基因是外显子(exon)和内含子(intron)相间排列的结构。;核苷酸上存在修饰成分,例如甲基化,磷酸化等。 转录方式为后转录,即翻译在转录之后进行,两者是独立分开;第四章 核酸;一、物理性质 形态:DNA结晶为白色纤维状,RNA结晶为白色粉末状。 溶解性:DNA,RNA都微溶于水,不溶于有机溶剂,例如乙醇 大小:DNA约为 5×103~1.2×108 bp,分子量约为3.3×103~8×1010 kD;RNA约为几十到上千bp,分子量约为几万到几十万道尔顿。 等电点:DNA pI=2.0~2.8,RNA pI=4~4.5;二、紫外吸收性质   由于核苷酸具有共轭双键,所以核酸在 260 nm处有最大吸收值。 =2????? 为 RNA ?A260/A280? ??=1.8?? 为 DNA ??????????????????? <1.8?? 为含有蛋白质,核酸的混合物;三、

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