第六章 酶的人工模拟 酶工程课件.pptVIP

Enzyme Engineering酶工程 第六章 酶的人工模拟 第一节 模拟酶的理论基础和策略 第二节 模拟酶的分类和制备 第三节 印迹酶 第一节 模拟酶的理论基础和策略 一．模拟酶的概念 二．模拟酶的理论基础 三．设计要点 一．模拟酶的概念 酶是由蛋白质构成 ,一般对酸、碱、热不稳定 ,容易失活变性 ,这限制了它们的广泛应用。模仿天然酶对底物的分子识别和高效催化的模拟酶研究是一个很有意义的研究领域 ,也是近十多年来生物化学和有机化学的重要课题。 模拟酶的概念 模拟酶又称为人工酶或酶模型。对模拟酶至今没有一个公认的定义。 一般来说，它的研究就是吸收酶中那些起主导作用的因素，利用有机化学、生物化学等方法设计和合成一些较天然酶简单的非蛋白质分子或蛋白质分子，以这些分子作为模型来模拟酶对其作用底物的结合和催化过程。 模拟酶是在分子水平上模拟酶活性部位的形状、大小及其微环境等结构特征，以及酶的作用机理和立体化学等特性的一门科学。 二．模拟酶的理论基础 １.模拟酶的酶学基础 酶的作用机制：过渡态理论 对简化的人工体系中识别、结合和催化的研究。在设计模拟酶时除具备催化基团之外，还要考虑到与底物定向结合的能力。模拟酶要和酶一样，能够在底物结合中，通过底物的定向化，键的扭曲及变形来降低反应的活化能。此外，酶模型的催化基团和底物之间必须具有相互匹配的立体化学特征，这对形成良好的反应特异性和催化效力是相当重要的。 2.超分子化学 主-客体化学：主要研究主体（通常为较大的有机配体）和客体（通常为较小的分子和离子）的结构、性能及相互作用。主体和客体在结合部位的空间及电子排列的互补 主体和客体通过配位键或其他次级键形成稳定复合物。 主客体化学是超分子化学的雏形，它与超分子化学之间并没有绝对的界限和区分。 2.超分子化学 超分子：是指由两种或两种以上分子依靠分子间相互作用结合在一起，组成复杂的、有组织的聚集体，保持一定的完整性，使它具有明确的微观结构和宏观特性。 超分子形成源于底物和受体的结合，这种结合基于非共价键相互作用，如静电作用、氢键和范德华力等，当接受体与络合离子或分子结合形成稳定的，具有稳定结构和性质的实体，形成超分子。 2.超分子化学 分子识别和自组装是超分子形成的两个重要方面 形成超分子时，要求分子间达到能量和空间结构的匹配，称之为识别 有一定方向性和选择性的强作用力，成为分子识别和自组装的主要作用力 举例：拆分剂应用于消旋体的手性拆分：手性拆分剂与消旋体混合物中的一个对映体最少同时有三个相互作用，这些作用中至少一个是由立体化学决定的。拆分剂与两种对映体形成的复合物在许多物理性质上（如溶解度、熔点等）存在差异，因此，利用这些差异可将两复合物分开，从而达到拆分的目的。 2.超分子化学 1987年诺贝尔化学奖由三位科学家共同获得。 C.Pedersen:发现冠醚化合物 J-M.Lehn：发现穴醚化合物并提出超分子概念 D.Gram：主客体化学先驱者 三．设计要点 设计前需要具备的知识： 酶活性中心-底物复合物的结构 酶的专一性及其同底物结合方式的能力 反应的动力学及各中间物的知识 三．设计要点 设计中： 为底物提供良好的微环境，便于与底物或过渡态以离子键、氢键结合。 选择的催化基团必须相对于结合点尽可能同底物的功能团相接近，以促使反应定向发生。 模型应具有足够的水溶性，并在接近生理条件下保持其催化活性 三．设计要点 模拟酶的设计主要包括两大类： １. 利用现有的酶或蛋白质为母体，引入相应的催化基团，形成酶的化学修饰物。 2. 以合成的高分子聚合物为母体，根据酶的活性部位结构，连接上所需的功能基团或金属配合物。 三．设计要点 模拟酶的设计举例： (1) 模拟酶只含有与生物活性酶相同的金属离子———第一级近似。如超氧化物歧化酶(SOD) 是以铜为辅基的蛋白质配合物,而铜的某些氨基酸或羟基配合物,可用作模拟物,它们具有一定程度的SOD 活性。尽管模拟物的作用机理、选择性及反应效率不同于原来的酶,但因可大量合成,仍有实用价值。 三．设计要点 模拟酶的设计举例： (2) 模拟活性中心结构。人们用三亚乙基四胺合成铁( Ⅲ) 配合物来模拟过氧化氢酶。用该化合物来进行如催化机理的研究显得很方便。结果证明该铁( Ⅲ) 配合物催化分解过氧化氢的速度相当接近过氧化氢酶的速度。 三．设计要点 模拟酶的设计举例： (3) 整体模拟。活性中性必须处在一个特定的微环境和整体结构之中,所以高级模拟是包括微环境在内的整个活性部分。Collman 等合成了围栅型铁( Ⅱ) 卟啉用以模拟血红蛋白的可逆载氧,效果良好。 第一节结束 点击返回 第二节 模拟酶的分类和制备 一.根据Kirby分类法 二.按照模拟酶的属性 三.制备举例——水解酶的模拟 四.研究