红松SSR-PCR反应体系的建立与优化 Establishment and optimization of the SSR-PCR reaction system in Pinus koraiensis Sieb.et Zucc..pdfVIP
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红松SSR-PCR反应体系的建立与优化 Establishment and optimization of the SSR-PCR reaction system in Pinus koraiensis Sieb.et Zucc.
第28卷第1期 经济林研究 VoI.28No.1
2010年3月 NonwoodForestResearch Mar.2010
红松SSR—PCR反应体系的建立与优化
冯富娟18,赵丹仲,孙晓艳h,韩士杰2,许小妍h
(1.东北林业大学a.生命科学学院;b.林学院,黑龙江哈尔滨150040;
2.中国科学院沈阳应用生态研究所,辽宁沈阳110016)
摘要: 为了建立红松SSR—PCR最佳反应体系,以CTAB法提取的红松针叶DNA为模板,应用单因子试验及L。。
影响,并对延伸时间。热循环参数进行了探讨,建立了稳定的、可重复的红松SSR—PCR最佳反应体系及PCR扩增参
XPCRbuffer mmol/L,
数。结果表明,PCR的最佳反应体系为:10L体系中,I 1肛L、DNA模板50~120ng,M92+3
dNTP0.4mmol/L,引物0.5弘mol/L,Taq酶0.75U。利用该体系筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物13
对。在此反应体系下,所扩增谱带清晰、稳定、多态性高。
关键词: 红松)SSR;优化;正交设计;单因子试验
中图分类号:Q75;$791.247文献标志码:A
Establishmentand oftheSSR—PCRreaction
optimization
in Sieb.et
PinuskoraiensisZucc.
system
FENG Danl“,SUN
Fu—juanl。,ZHAO Xiao—yanl4,HANShi—jie2。XUXiao—yanl‘
(1.a.Schooloflifescience;b.Schoolof
Forestry,NortheastForestryUniversity,Harbin
2.Instituteof of
Applied AcademySciences,Shenyang
Ecology,Chinese 110016,Liaoning,China)
in from
Abstract:InordertOestablishthe SSR—PCRreaction Pinus DNAextracted
optimal system koraiensis,taking
needleas effectsofconcentrationsof and on
template。the templateDNA,Mg“,dNTPs,primerTaqpolymerase
and test
SSR—PCR were themethodofCTAB factortest ofL16(45),
amplificationanalyzedby usingsingle
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