thrsp基因5’调控区多态性对猪主要产肉性状遗传效应研究word论文.docxVIP

摘要猪的产肉性状包括日增重、膘厚和眼肌面积等，影响产肉性状的基因众多而复杂， 其中与脂肪沉积相关的基因则是通过调控胴体脂肪的生成与沉积作用直接或间接地 影响产肉性状。THRSP 是甲状腺素受体调控激活的转录因子，THRSP 基因主要在脂 肪组织中表达，是调控脂肪沉积的主效基因，本研究旨在探索 THRSP 基因的多态性 对猪产肉性状的遗传效应。试验选择长白、大白、红杜洛克和白杜洛克种猪 924 头作为供试猪，测定的产肉 性状包括日增重（ADG）、平均背膘厚（ABF）、眼肌面积（EMA）、肉脂率（ABF/EMA× 100，MFR）。所有供试猪均按照场方常规的饲养管理进行。采集供试猪耳组织提取 DNA， 通过测序方法检测 THRSP 基因 5’调控区的 SNPs，计算基因频率，利用固定效应模型 分析各基因型对性状的效应以及贡献率，估计性状基于 SNP 位点的遗传力，评估 THRSP 基因多态性与猪产肉性状之间的关联性。结果表明：目的片段共存在 5 个 SNP 位点，分别为 C-459T、T-400C、G-376A、G-98A 和 A-95T， 分别位于 THRSP 基因 CDS 起点的上游-459bp, -400bp, -376bp, -98bp 和-95bp 位置。T-400C/G-376A 位点组合具有较高的固定效应，其中 400TT376GG 基因型对 ADG（-10.6938 g）和 EMA（-2.9184 cm2）具有负效应，对 MFR（2.2895）具有正效应。 400TT376GG 基因型对眼肌面积（-8.80%）和肉脂率（7.49%）的贡献最大（P0.01）， 其他基于单个位点的基因型均偏小（P0.05）。在 5 个位点的联合基因型中，以 CCTTGGGGAA 对眼肌面积（-7.61%）和肉脂率（6.44%）的贡献最大（P0.01），和 400TT376GG 基因型的贡献率一致。MFR、EMA、ADG 和 ABF 基于 T-400C/G-376A 的点遗传力分别是 0.2621、0.1918、 0.0337 和 0.0086；基于其他位点的所有性状点遗传力都低于 0.0130。可见,THRSP 基因 T-400C/G-376A 联合位点与猪产肉性状密切相关，可能是 MFR 和 EMA 的主效基因 座。关键词：猪，产肉性状，THRSP 基因，点遗传力，SNP，主效基因座IAbstractThe meat production traits include daily gain, backfat thickness and loin muscle area in pig, and affected by many complicated factors. The genes related to fat deposition directly or indirectly influence the meat production traits by regulating the ways of carcass lipogenesis. THRSP is a transcription factor and activated by thyroid hormone receptor, and regarded as a major gene in the regulation of fat deposition. This study aimed to explore the genetic effect of THRSP gene polymorphism on pig meat production traits.924 pigs were selected from Landrace, Large White (LW), Duroc and White Duroc (WD), and fed under the same growing environment (raising condition). The average daily gain (ADG), average backfat thickness (ABF), eye muscle area (EMA), ABF/EMA×100 (meat-fat ratio, MFR) were measured. Five SNP sites and their genotyping were detected using sequencing in 5 regulatory region of THRSP gene, then calculating the gene frequencies and analyzing the fixed effects and