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生物芯片 生物芯片概述 基因芯片 蛋白质芯片 生物芯片（biochip）概述 生物芯片是90年代初期随着人类基因组计划的顺利进行而诞生，它是通过象集成电路制作过程中半导体光刻加工那样的微缩技术，将现在生命科学研究中许多不连续的、离散的分析过程（如样品制备、化学反应和定性、定量检测等手段）集成于指甲盖大小的硅芯片或玻璃芯片上，使这些分析过程连续化和微型化。 生物芯片的原理 生物芯片（biochip）：基于生物大分子（核酸和蛋白质等）相互作用的大规模并行分析方法，并结合微电子学、微机械、化学、物理和计算机等多领域的技术及生命科学研究中所涉及的样品反应、检测和分析等连续化、集成化和微型化的过程。它以载玻片和硅等材料为载体，在单位面积上高密度地排列大量的生物分子，从而达到一次试验同时检测多种疾病或分析多种生物样品的目的。 生物芯片的分类 基因芯片/DNA芯片/DNA微阵列 蛋白质芯片 基因芯片 基因芯片的原理 基因芯片的分类 基因芯片的特点 基因芯片技术的基本要点 基因芯片的应用 基因芯片存在的问题 基因芯片的原理 采用原位合成或直接点样的方法将DNA片段或寡核苷酸片段排列在硅片、玻璃等介质上形成微矩阵，待检样品用荧光分子或同位素标记后与微矩阵杂交，通过信号扫描及计算机分析即可获得样品中大量的基因序列及表达信息，以达到快速、高效和高通量地分析生物信息的目的。 基因芯片的分类 寡核苷酸芯片 cDNA芯片 高度平行性 多样性 微型化 自动化 基因芯片技术的基本要点 DNA方阵的构建 样品的制备 杂交 杂交图谱的检测及读出 DNA方阵的构建 方法：原位合成法和直接点样法。 改进：用PNA代替DNA制成芯片。 肽核酸（Peptide Nucleic Acid，PNA） 肽核酸（PNA）是具有类多肽骨架的DNA类似物。 PNA的主链骨架是由N-（2-氨基乙基）-甘氨酸与核酸碱基通过亚甲基羰基连接而成的。 DNA与PNA的结构 肽核酸的特点 1.PNA不象DNA那样在核糖磷酸骨架中存在带负电的磷酸基团，因而杂交时不需盐离子以抵消DNA链之间的静电排斥。PNA与核酸的杂交能力强于核酸间的杂交能力，不会因静电斥力形成自身二级或三级结构。 2.热稳定性高于核酸间的杂交体，碱基配对的特异性大大提高。 3.抗酶解能力极强。由于其非肽和非核酸的结构特点，蛋白酶和核酸酶均不能降解PNA。 目前，PNA被广泛用于化学、生物学、反义药物、分子识别和遗传诊断等领域。 例如：PNA可以特异性地与DNA或RNA杂交，形成稳定的复合体。它可以对DNA复制、基因转录和翻译等进行有针对的调控，同时作为杂交探针大大提高了遗传学检测和医疗诊断的效率和灵敏度。 杂交图谱的检测及读出 扫描仪的分类： 激光共聚焦显微镜原理：灵敏度和分辨率较高，扫描时间长，比较适合研究用。 CCD （电荷耦合组件）摄像原理：灵敏度和分辨率较低，扫描时间短，比较适合临床诊断用。 激光扫描共聚焦显微镜 激光扫描共聚焦显微镜是采用激光作为光源，在传统光学显微镜基础上采用共轭聚焦原理和装置，并利用计算机对所观察的对象进行数字图象处理的一套观察、分析和输出系统。 主要系统包括：激光光源、自动显微镜、扫描模块（包括共聚焦光路通道和针孔、扫描镜、检测器）、数字信号处理器、计算机以及图象输出设备（显示器、彩色打印机）等。 应用：通过激光扫描共聚焦显微镜，可以对观察样品进行断层扫描和成像。因此，可以无损伤地观察和分析细胞的三维空间结构。同时，通过激光扫描共聚焦显微镜也是活细胞的动态观察、多重免疫荧光标记和离子荧光标记观察的有力工具。 CCD CCD（电荷耦合组件）是应用在摄像和图像扫描方面的高端技术组件。 它通常在同一块硅片上同时制作出光电二极管阵列和移位寄存器。 移位寄存器的作用：把曝光完成后光电二极管上积累的电荷移走，然后进行放大，接着进行A／D转换，把模拟的电量转化为数字量。 基因芯片的应用 基因芯片技术发展到今天不过短短十几年时间，虽然还存在这样或那样的问题，但其在序列分析、基因表达谱分析、基因诊断、药物筛选等诸多领域已呈现出广阔的应用前景。随着研究的不断深入和技术的更加完善，基因芯片一定会在生命科学研究及应用领域发挥出其非凡的作用。 在分子生物学研究中的应用 临床基因诊断与治疗 药物筛选、药代学研究和指导用药 预防医学研究 环境保护 军事和司法 农业 在分子生物学研究中的应用 测序 人类基因组计划的实施促进了更高效率的、能够自动化操作的测序方法的发展。芯片技术中杂交测序（sequencing by hybridization，SBH）技术及邻堆杂交（contiguous stacking hybridization，CSH）技术即是一种新的高效快速测序方法。 基因表达谱、基因分型以及寻找新基因