[农学]生物化学3-蛋白质的共价结构.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 西北农林科技大学 郭泽坤 细胞色素c—cytochrome c 一种含血红素的电子转运蛋白，存在于所有真核生物的线粒体中 一百零几个氨基酸，12.5kD 对40多种物种的细胞色素c的分析揭示，多肽链中28个位置的氨基酸是完全相同的 说明这些不变残基对这种蛋白质的生物学功能是至关重要的，在这些位置上不允许被其它氨基酸所取代。 17和14位上的Cys参与结合辅基血红素 70-80的不变残基串可能是细胞色素c与酶结合的部位。 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 可变残基提供了另一类信息：通过序列分析得出一个重要结论 来自任两个物种的同源蛋白质，其序列间的氨基酸差异数目与这两个物种的系统发生差异是成比例的，也就是在进化位置上相差越远，其氨基酸序列之间的差别越大。 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 Carp:鲤鱼；snail:蜗牛；moth:峨；cauliflower；花椰菜；parsnip:防风草 西北农林科技大学 郭泽坤 系统树—phylogenetic tree 或称进化树 系统树是用计算机分析细胞色素c序列并找出连接分支的最小突变残基数的方法构建起来的 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 同源蛋白质具有共同的进化起源 Amino acid sequence analysis reveals that proteins with related functions often show a high degree of sequence similarity. Such findings suggest a common ancestry for these proteins. 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 丝氨酸蛋白酶(Serine Proteases)trypsin, chymotrypsin和elastase这些酶的活性中心的特异丝氨酸起关键性作用，根据这类酶序列的同源性，推论它们也是经过祖先丝氨酸蛋白酶基因的复制而进化来的 西北农林科技大学 郭泽坤 一些功能差异很大的蛋白质，如卵清中的溶菌酶(lysozyme,129个氨基酸，水解细菌细胞壁的多糖成分)和人乳中的α-乳清蛋白(α-lactalbumin,123个氨基酸，调节乳腺中乳糖的合成)，功能差异很大，但具有相似的三级结构和序列同源性，说明它们也具有共同的进化起源。 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 总之，基因的突变和复制是创造多样性的重要进化力。 许多蛋白质具有共同的进化起源，只不过进化的时间和进程抹去了它们有共同祖先的大部分证据。 西北农林科技大学 郭泽坤 * * * * * * * * * * * * * * (All of these treatments disrupt polar interactions such as hydrogen bonds both within the protein molecule and between the protein and the aqueous solvent.) * An important consideration is to carry out these cleavages so that the original or even new SOS links do not form. * 西北农林科技大学 郭泽坤 Step 3. Analysis of Amino Acid Composition 酸水解：6N HCl，110℃，10-24h Trp is destroyed Ser，Thr，Tyr are slowly destroyed asparagine (Asn) and glutamine (Gln) become aspartic acid (Asp) and glutamic acid (Glu) the concentrations of Asp and Glu determined in amino acid analysis are expressed as Asx and Glx, respectively. 西北农林科技大学 郭泽坤 西北农林科技大学 郭泽坤 Step 4. Identification of the N- and C-Terminal Residues 第一可以确定多肽链的N-末端和C-末端的氨基酸 第二可以确定蛋白质是否为异源多聚体 西