[生物学]Chapter 9 真核基因表达调控.ppt

删除四膜虫的所有编码H1的基因，不会明显影响对染色质的整体机构特征，对有丝分裂时染色质凝集的影响也不大；但有些基因被活化了，而有些被抑制了。这表明局部结构发生了改变。突变H1上的磷酸化位点，不会产生效应；但如果突变是模仿H1磷酸化的，则表型类似删除编码H1的基因。这表明H1的磷酸化能够消除它在局部染色质机构的作用。 H3上第10位Ser（H3S10）磷酸化与转录活化相关（促进H3K14的乙酰化），也与染色质凝集和有丝分裂的进展相关。果蝇的磷酸化H3S10的激酶JIL-1如果缺失，对于染色质结构是灾难性的，比较正常（上图）果蝇与缺失激酶JIL-1的无效突变体（下图），发现多线染色体组的延伸情况明显不同。缺失JIL-1是致死性的，但在尚未死亡的幼虫中可以观察到染色体。 Figure 9.53 缺失JIL-1激酶的果蝇突变体，多线染色体异常，表现为致密浓缩而不是正常的伸展状态。 很可能是H3不能磷酸化导致染色体结构破坏（当然JIL-1还有其它底物），这表明要生成常染色质区域的更为延展结构需要H3的磷酸化。研究显示，在雄性个体中，JIL-1与结合X染色体的蛋白相互作用，促进其上的基因的表达；依赖JIL-1的H3S10磷酸化还拮抗标志着异染色质状态的H3K9的二甲基化。这些结果与JIL-1具有促进染色质形成活跃构象的作用是一致的。 有趣的是，JIL-1对H3K10的磷酸化可由H4K12促进（由ATAC乙酰化酶负责）。这些复杂的相互作用使得我们很难判断，对染色质结构的转变而言，是单一的修饰起关键作用，还是几种修饰必须同时发生。 H3的磷酸化既促进有转录活性的染色质形成，也是起始染色质凝集所需要的（至少在某些物种，包括哺乳动物和四膜虫），这二者是如何联系起来的，还不清楚。 这使我们对于组蛋白磷酸化的作用产生迷惑：它对于细胞周期很重要，可能是染色质致密化的信号；而它对于转录和修复的作用则相反，即组蛋白磷酸化有助于染色质结构的打开，利于转录的活化和修复的进行。当然不同的组蛋白甚至组蛋白上不同的氨基酸残基的磷酸化，可能对染色体结构具有相反的作用。 超敏感位点是指染色质上的对DNAase I 或其它核酸酶异常敏感的一段很短的区域，该区域不含核小体。 A hypersensitive site is a short region of chromatin detected by its extreme sensitivity to cleavage by DNAase I and other nucleases; it comprises an area from which nucleosomes are excluded. 附：DNA酶 I 超敏感位点体现了染色质结构的变化 摘译自 GENES IX 29.18; GENES X 10.11 活跃或潜在的活跃区域除了通常的变化，特定位点还会发生与转录起始或DNA上某些结构有关的变化，这些变化最早是在使用极低浓度的DNAase I消化时发现的。 以 DNase I （DNA酶 I）处理染色质，某些位点首先发生双链断裂，这些位点称作超敏感位点（hypersensitive sites）。这些位点反映的是这段染色质可以接近，代表了未组成核小体的暴露状态的DNA。典型的超敏感位点要比整个染色质区域敏感100倍。当然这些位点也对其它的核酸酶和（能断裂DNA）的试剂敏感。 通过鉴定、分析乙酰化酶和去乙酰化酶，以及研究它们与特异激活和抑制过程中涉及的蛋白的共同作用，对HAT的认识有所突破，使我们关于组蛋白乙酰化的认识发生了基本改变：许多已知的转录激活因子也具有HAT活性。 当发现了A组HAT的一个亚基是酵母调节蛋白Gcn5的同源物时，这种联系建立起来。随后发现Gcn5本身也有HAT活性（底物是H3和H2B）当初，Gcn5是作为介导某些增强子和靶启动子之间相互作用的连接复合物的一个成分而鉴定出来的；现在知道，其HAT活性是许多靶基因活化所需的。 Gcn5是原型HAT，它使研究人员鉴定出了一个大家族的乙酰基转移酶复合物，从酵母到人都是保守的。 酵母中，Gcn5是 1.8 MDa SAGA（Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase）复合物的一部分，SAGA还包括一些与转录有关的蛋白，这些蛋白中有TAFIIs。而且，TFIID中的TafII1亚基自身就有HAT活性。TFIID与SAGA的作用有一定重叠，只突变TafII1或Gcn5酵母能够存活，都删除后则不能存活，这表明乙酰化活性对于基因表达必不可少，这种活